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目的抑癌基因启动子区异常甲基化是表观遗传学重要机制之一,参与了胃癌的发生发展。本研究采用甲基化特异性PCR (MSP法)和亚硫酸氢盐修饰后测序法(BSP法)方法检测手术切除胃癌组织中抑癌基因RUNX3和CHFR启动子区甲基化状态,并对入组的胃癌术后患者进行术后生存随访,探讨RUNX3和CHFR基因启动子的异常甲基化状态与胃癌临床病理特征以及生存期之间的关系。方法选择经病理确诊的123例原发性胃癌患者,胃癌患者术前均未行放疗和化疗,癌组织均取自肿瘤组织的中心位置,同时收集30例胃黏膜良性病变组织为对照组织。应用MSP方法和BSP方法检测标本中RUNX3和CHFR基因启动子区甲基化水平。随访胃癌患者的生存时间,预后单因素分析采用Kaplan-meier曲线,应用log-rank检验;预后多因素分析采用Cox比例风险模型。结果1.胃癌组织中RUNX3和CHFR基因启动子区甲基化频率分别是54.4%和41.4%,而它们在对照的胃良性病变组织中的甲基化频率均是0%,RUNX3和CHFR在胃癌组织中的甲基化频率显著高于它们在胃良性病变中的甲基化频率(P<0.05)。2.在≥5cm的胃癌组织中,RUNX3和CHFR启动子区甲基化频率分别是62.7%和49.3%,在<5cm的胃癌组织中,RUNX3和CHFR的甲基化频率分别是41.7%和29.2%,RUNX3和CHFR在≥5cm的胃癌组织中的甲基化频率分别显著高于它们在<5cm的胃癌组织中的甲基化频率(PRUNX3 = 0.023, PCHFR = 0.027);RUNX3在T3/T4期和T1/T2期的甲基化频率分别是62.2%和33.3%,前者显著高于后者(PRUNX3 = 0.004);CHFR在G3/G4期和G1/G2期的甲基化频率分别是50.0%和25.6%,前者显著高于后者(PCHFR = 0.009);经过统计学分析,RUNX3和CHFR甲基化频率和非甲基化频率在胃癌患者中的其它临床病理资料包括性别、年龄、病理分期、淋巴结转移中的差异均无显著性(P>0.05)。3.胃癌组织中CHFR基因启动子区甲基化阳性的患者术后生存期较阴性患者的术后生存期显著缩短(P = 0.03)。而癌组织中RUNX3甲基化阳性患者的术后生存期与阴性患者的术后生存期相比无统计学意义(P = 0.27),在其他生存单因素分析中年龄、性别、组织分化程度、淋巴结转移情况、病理分期、肿瘤浸润深度均没有显示出统计学差异,唯有肿瘤大小中<5cm患者中位生存期优于≥5cm患者(P=0.04)。结论1. RUNX3和CHFR基因启动子甲基化与胃癌患者的病理特征有显著相关性,提示这些基因在胃癌的发生发展中具有重要作用。2.胃癌组织中CHFR基因启动子区甲基化阳性患者的生存期较其甲基化阴性患者的明显缩短,提示CHFR基因的甲基化状态可能作为评估胃癌患者术后生存期的分子指标。