玉米和水稻产量及品质性状的关联分析研究

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随着全基因组测序技术的发展,可供研究利用的SNP信息越来越多,这为采用GWAS(全基因组关联分析)方法揭示复杂性状的遗传机理提供了可能。然而,目前的GWAS研究所采用的遗传模型往往忽略了上位性效应(基因与基因互作)及基因与环境互作效应。造成此种情况的原因:一方面可能是没有合适的统计方法去检测上位性及基因与环境互作,另一方面可能是全基因组基因与基因二维(互作)扫描的计算压力太大,耗时太长。本研究采用GPU-GMDR(基于GPU的广义多因子降维法)与混合性线性模型相结合的GWAS研究策略,探究玉米NAM
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