微卫星是一种广泛应用的遗传标记。随着研究的不断深入，要求从基因组中大量筛选微卫星位点。传统的筛选方法虽然被普遍采用，但仍存在着许多缺点和不足，如需要构建基因文库、内切酶的使用以及筛选出的位点重复率高等。文库构建耗时、费力，且对技术、经验要求较高；由于内切酶切点分布的随机性，许多微卫星位点克隆中仅保留极少部分侧翼序列，因而无法设计引物；重复率高耗费了大量的经费和劳动力。本研究创建了一种基于锚定PCR的筛选方法，从东北虎基因组中筛选了大量的微卫星位点，有效克服了上述问题。首先进行一个单引物PCR，在微卫星重复区内设计单引物Str-ACN，并在引物3’末端锚定一个碱基。然后利用末端脱氧核糖核酸转移酶在PCR产物的3’末端上加一poly-C结构。再利用另行设计的引物GG-N与Str-ACN配对进行双引物扩增，扩增产物克隆测序后，得到的就是微卫星位点的下游序列。根据此下游序列再设计一个引物Nest1，利用相同的原理向上游扩增，克隆测序得到上游序列，这样就得到了完整的微卫星位点。最终本研究通过这种筛选方法，在第一次克隆测序的149个样品中共得到147个不同的微卫星位点的下游序列。从中随机抽取26个微卫星位点用于上游序列的扩增和测序，共得到24个完整的微卫星位点。