目前国内百合杂交育种工作正在陆续地展开,杂交育种因能够整合两个或两个以上亲本的优良特性而成为创造新型种质的重要手段。本研究以亚洲杂种系、麝香杂种系和OT杂种系百合品种为杂交亲本,共设计26个杂交组合进行杂交亲和性实验,并通过常规授粉与胚培养的方式成功获得杂交种；利用ISSR-PCR与RAPD分子标记对杂种真实性进行综合鉴定；并对部分亲本材料进行核型分析研究。主要研究结果如下：1、部分亲本染色体核型分析。本研究中的6个百合栽培品种,它们的染色体不仅结构变异丰富,而且数量也各异,分别存在2倍体、3倍体和4倍体品种,其中’Vermeer’还存在非整倍体,核型以稳定的3B型为主。染色体中以st和t染色体所占的比例大,染色体长度比大,核型对称性差,符合对称原始,不对称进化的观点。2、杂交亲和性。亚洲百合系内杂交亲和性比较好,采用常规授粉13个杂交组合中,有6个杂交组合获得有胚种子；系间杂交与OT杂种系内亲和性均较差,蒴果多瘦弱,维系时间很短,而以’White Heaven’为母本的6个系间杂交组合中,有4个组合获得少量的杂种胚,所以亲本的选定对杂交种子的获得至关重要。在多数亚洲百合系内杂交中,蒴果长/宽比与有胚率、维系时间、结实率成反比关系,表明蒴果的膨大程度与维系时间可以作为早期判断杂交亲和性的外观指标,而用有胚率作为判断依据更为直接可靠。3、杂种胚拯救。授粉后50-60d左右进行胚培养。筛选出较适培养基：MS+NAAO.Olmg/L+6-BA0.1mg/L+蔗糖30g/L。蔗糖浓度在3%-6%之间,百合幼胚均能正常生长。4、杂交苗的鉴定。通过ISSR-PCR与RAPD分子标记技术,对获得的6个杂交组合后代进行杂种真实性分析鉴定。从16条ISSR引物中筛选出4条引物对所有样品进行PCR扩增,共扩增出57条DNA条带,其中46条多态性条带,占总数的80.7%。利用2条RAPD引物扩增出27条DNA条带,其中20条为多态性条带,占总数的74.1%。通过两种分子标记鉴定表明,6个杂种后代大部分条带与父母本相同且扩增出特异带型,确定该6个杂交组合后代均为真杂种。