由于审计人员是有限理性的经济人，作为监督工作的国家审计难免不出现偏差或错误，风险必然存在。注册会计师审计已发生了多次风险事件，审计界对独立审计风险研究较多，但对国家审计风险研究较少、起步较晚，对财政预算执行审计风险研究更少了。然而财政预算执行审计在我国政治、经济生活中位居重要地位，因此，研究财政预算执行审计风险问题，有重要的理论意义和现实价值。 然而，财政预算执行审计风险是一个庞杂的课题，作为一篇容量有限的学位论文，只能选择其中的几个问题进行探讨。总体上本文可分为两大部分，一是关于财政预算执行审计风险的特性与控制原理的研究，二是关于降低财政预算执行审计风险的两大对策研究—提高独立性与改进审计方法。 本文主要运用演绎研究、比较研究与案例研究的方法，试图论证如下观点，实现一定程度上的创新：(1)财政预算执行审计由于财政预算及其审计的特殊性，其风险也有自己的特点，那就是风险主体的持续性、风险客体的广泛性与风险影响的严重性及处罚的风险性；(2)与财政预算执行审计风险特性相对应，财政预算执行审计风险控制的主要力量来自审计机关及人员、行政复议与行政诉讼制度、人大与社会舆论等，在控制措施上应注意六个方面的综合运用；(3)提高审计机构、人员及经费的独立性是降低财政预算执行审计风险的根本之所在，为此，必须针对现实问题进行一系列改革；(4)账项基础审计、制度基础审计与风险导向审计作为审计方法，各有优劣，为本文提出的目标导向法奠定了基础，通过我们的实践，我们发现目标导向法是降低我国财政预算执行审计风险的理性选择。