土壤盐碱化是影响植物种子萌发和生长发育的主要环境胁迫限制因子。本研究通过水杨酸浸泡紫花苜蓿种子处理,并应用非损伤测试技术测定紫花苜蓿根尖分生区和伸长区的离子流速,探讨紫花苜蓿在盐碱胁迫下种子萌发、幼苗生长、生理生化及抗逆性的应答特征,并基于转录组测序、代谢组分析和qRT-PCR,验证与抗逆相关的目标功能基因的富集模式以及代谢产物的变化,旨在为紫花苜蓿在盐碱地土壤适应性栽培提供科学依据。以0.5 mmol/L和1 mmol/L水杨酸分别浸泡公农一号和东苜一号紫花苜蓿种子24 h,进行温室条件下盐碱土盆栽试验。生长4个月后取样测定种子萌发率、鲜重、干重、株高及根长,同时测定紫花苜蓿叶片叶绿素、脯氨酸、可溶性糖、丙二醛含量及渗透势等耐盐碱评价生理参数,以及选取水杨酸浓度为0.5 mmol/L处理的紫花苜蓿叶片为材料,进行转录组测序和qRT-PCR验证,探讨与抗逆有关的目标功能基因的富集特征。利用非损伤测试技术测定生长一个月的东苜一号紫花苜蓿幼苗根尖部位Na~+、K~+、H~+离子流速,选取生长4个月后的紫花苜蓿叶片进行代谢组分析。适宜浓度的外源水杨酸浸泡紫花苜蓿种子有效提高了紫花苜蓿种子发芽率,促进了紫花苜蓿生长,增加了株高、根长、鲜重和干重,促进了植株的叶绿素、脯氨酸和可溶性糖的积累,显著降低了紫花苜蓿叶片渗透势和丙二醛含量。转录组测序表明,0.5mmol/L水杨酸处理公农一号和东苜一号紫花苜蓿分别诱导出31个和123个差式表达基因,这些差式表达基因的富集可能对紫花苜蓿耐盐碱性的改善具有促进作用。非损伤测试表明,外源水杨酸浸种调节了东苜一号紫花苜蓿离子平衡,而代谢组分析表明,0.5mmol/L水杨酸诱导了东苜一号紫花苜蓿241种差异代谢物的变化,并影响到代谢途径对盐碱胁迫下的信号物质调节。在盐碱胁迫条件下,水杨酸浸泡紫花苜蓿种子可以减少盐碱胁迫对紫花苜蓿生长过程中所造成的伤害,且水杨酸浓度为0.5 mmol/L时效果最佳;外源水杨酸明显地导致差式表达基因的富集模式发生改变,并作为外源信号物质参与了抗逆相关基因的富集,差异代谢物参与了与抗逆相关的代谢途径调节。本研究为揭示外源水杨酸在紫花苜蓿盐碱胁迫分子响应机制的深入探索提供了有效的科学参考。