我国政府为了兴利除害，造福人类，修建了大量的水电工程项目，在发电、防洪、灌溉以及生态等方面发挥了巨大的效益，为我国的国民经济和社会的发展作出了巨大的贡献。但是，长期的工程建设，产生了大量的移民，使我国成为世界非自愿移民人数最多的国家之一。水库移民工作则成为国家的重点、难点，是工程成败的关键。水库移民的核心问题是移民生产生活水平恢复问题。在水库移民搬迁安置后，国家对其实行了后期扶持政策，水库移民后期扶持资金数额巨大、涉及面宽，为保证后期扶持资金高效使用，做好后期扶持资金的管理工作，即加强资金在筹集、拨付、使用等方面的管理至关重要。后期扶持资金管理是当前移民工作中值得探讨研究的问题。　　 本文从水库移民后期扶持政策实施的范畴、必要性，国内外水库移民资金管理的现状以及我国现行的资金管理办法入手，分析了现行后期扶持资金管理存在的问题及影响因素。本文针对后期扶持资金管理的现状及存在的问题，引入了集成控制思想对后期扶持资金进行管理，并用WBS方法对后期扶持资金分解，进而对后期扶持资金管理各阶段进行集成控制，并结合Y市样本县的后期扶持资金使用效益进行分析，并进一步提出、优化后期扶持资金的管理路径，本研究成果可为我国水库移民后期扶持资金管理办法、模式的创新，提供理论参考和方法依据，并帮助移民尽快脱贫致富。