随着我国改革开放的不断深入,“农民、农业、农村”这个基础问题越来越成为制约我国经济发展的瓶颈。“三农问题”的核心是农民问题,农民问题的核心是如何增加收入问题,然而自我国加入WTO以后,国外农产品大举进入我国,抢占我国市场。以家庭联产承包经营责任制为基础的小规模经营体制与外部的大市场之间的矛盾日益突出,农民增收受到多方面因素的制约。由于农业产业结构调整,规模经营和专业分工的发展,农民迫切需要加强社会化服务,需要能够带领他们直接进入市场,同时能够保护自身利益的互助组织。农民专业合作经济组织就是在市场经济条件下,广大农民群众为提高组织化程度而创建的一种自我组织、自我管理、自我服务、自我受益的新型合作组织,是农民群众在实践中的伟大创造。在国外尤其是在发达国家,农民合作组织已经形成了一个比较大的气候,而我国合作经济组织从80年代兴起以来,虽然经过多年的发展,与发达国家相比较,仍然处于初级阶段,覆盖面窄、市场化服务功能不强、影响范围小,组织的内部管理还不规范,运作的经营机制还不健全,实力还很弱,远远没有发挥出应有的组织优势。　　本文以新型农民专业合作经济组织的管理问题为切入点,采用了规范分析与实证分析相结合、微观分析与宏观分析相结合的研究方法,在论述过程中综合运用案例分析、比较分析等方法,在深入调查研究获得真实资料的基础上,归纳整理得出农民专业合作经济组织在管理中存在的各种问题,主要体现在:大多农民专业合作经济组织内部运作不规范,组织机构和管理制度不健全,内部管理决策不民主,产权制度不清晰,规模较小,辐射范围有限,融资不畅,资金短缺等。合作经济组织的发展和完善还受到外部经济和政治法律环境制约。本文结合萧县地区合作经济组织的发展实际,对制约新型农民专业合作经济组织发展的因素进行了分析,这些制约因素主要有农户和政府思想认识上的制约,农户的土地分散,以及一些外部环境制约因素包括相关法律不健全,基础设施不健全,政府政策扶持不配套,社员和管理者素质较低,高素质人才短缺等。在此基础上提出了从合作组织的内部与外部管理同时着手,完善内部管理机制,包括完善社员代表大会制度,完善理事会制度,健全激励和约束机制,完善监督机制,明确监事会的职权,完善合作社法人治理结构的责任体系,确保民主决策管理,兼顾效率,完善利润分配机制,加大对农民合作经济组织所需人才的培养;同时在合作组织外部必须完善政府职能,营造良好的外部经济环境,积极提供信息,多渠道募集资金,抓好试点示范,促进合作组织走向联合等,通过这些举措才能从深层次解决农民专业合作经济组织的管理问题,实现农民专业合作经济组织的健康发展。　　笔者结合实际,以问卷调查的形式深入调研萧县地区新型农民专业合作经济组织管理的现状和存在的问题,提出有针对性和可行性的解决方案,期望对推进新农村建设具有一定的现实意义。