实践中通说认为可将航空器留置权按照商事留置权的一般规定行使。商事留置权牵连关系“无因性”规定反而进一步造成了航空器留置权在行使过程中的内在利益冲突。此外,国内外规定的附着于航空器之上的特殊权利,例如航空器优先权、国际利益、航空器出租人取回权等,与航空器留置权同时出现于当事航空器之上时,又会产生航空器留置权行使的外在利益冲突。通过运用法经济学理论分析得出,要缓和航空器留置权行使中的利益冲突,应该坚持公平和效率平衡的价值目标,并以此作为解决航空器留置权行使的利益冲突的价值基础,从而找到一条符合航空器留置权行使特点的利益冲突解决路径。根据航空器留置权行使的内在利益冲突的表现和特点,以公平和效率价值平衡为基础,提出内在利益冲突的解决路径,其中主要包括对航空器牵连关系法律拟制的增补、排除善意取得制度的适用、增加通知为必经程序、同时将行使方式确定为强制司法拍卖等等。但航空器留置权不同于一般留置权,实践中还会遇到各种特殊情形,增加航空器留置权人的紧急行使权和债务人的替代担保权,将更利于完善航空器留置权的有效行使路径,从而解决航空器留置权行使中可能面临的内在利益冲突。航空器留置权行使的内在利益冲突的解决,并不意味着航空器留置权可以顺利行使。结合国内外相关法律和国际公约,研究并进一步分析航空器优先权、国际利益登记制度以及航空器出租人取回权与航空器留置权的协调行使顺位将有利于解决航空器留置权行使的外在利益冲突。