随着全球经济一体化进程的不断加快,世贸组织与贸易有关的知识产权协议进一步将知识产权的保护推进到了一个前所未有的广度和深度,确立了专利保护国际化的新趋势。近年来,药品专利国际保护的实践与公共健康利益之间的冲突,引起了广泛的争论和思考。为了能很好地平衡药品专利国际保护与公共健康利益的冲突,增强TRIPS的合法性,世贸组织就不发达国家的公共健康问题,经过艰苦的谈判,先后达成协议,发表了《TRIPS协议与公共健康宣言》和《关于实施多哈宣言第6段的理事会决议》,澄清了TRIPS中一直存在的含糊性规定,承认了发展中国家维护公共健康和获得药品的权利,使发展中国家可以利用协议的灵活性规定来保护本国公共健康,使最不发达国家有充分的时间重新考虑、调整本国的专利法。宣言确立的解释规则,使问题的解决朝着TRIPS协议的目标和原则方向前进,从而保障公众的健康和营养,以达到权利与义务的真正平衡。本文通过分析药品专利国际保护的现状,了解国际社会保护药品专利的实践,进而研究TRIPS协议下药品专利保护与公共健康利益的冲突问题。本文重点探讨TRIPS协议、《多哈宣言》和《总理事会决议》关于解决发展中国家公共健康和药品获得的具体规定,对其法律意义和局限性加以分析,探寻现有法律框架下解决冲突的具体途径,并从法理的角度反思专利制度中的利益平衡原则的失衡,提出重构这一原则的思路。最后,本文结合我国现状分析我国的药品专利保护制度和公共健康问题,指出我国法律规定的不足并提出完善建议。