长期以来,相当数量的违法行为由于缺乏有效的监管,严重损害了社会公共利益,而负有监管义务的各级行政机关则长期存在不作为、不履职的情形。我国于2017年6月确立了行政公益诉讼制度,并不断推进其发展与完善。目前全国各地的实践状况表明,行政公益诉讼不仅使得我国行政诉讼的构架更加完善与合理,更在维护国家和社会的公共利益、促进法治政府、法治社会和法治国家建设方面发挥了重要作用。但是,我国检察系统目前依然面临着行政公益诉讼司法实践经验不足、检察机关法定受案范围狭窄、法律在相关领域的规定不够清晰、案件线索发现和转化不畅、调查取证困难、判决难以执行等多方面问题亟待解决。基于以上问题,通过分析得出产生原因在于当前我国行政公益诉讼的司法经验不足,关于行政公益诉讼的各项法律法规不够明晰,行政违法行为的复杂性加剧了检察机关的监督困境,检察机关与行政机关存在矛盾等。在研究上述问题的过程中,通过分析行政诉讼制度的内涵、特点以及理论支撑,提出行政公益诉讼面临的实务困境应主要从法律体系中明确界定行政公益诉讼内涵并适度扩大受案范围、积极拓宽线索发现渠道、健全检察机关调查取证机制、加强民行队伍建设、明确诉前和诉讼程序的关系、完善诉前程序、完善检察机关与行政机关的机制运行和程序衔接、建立判决执行监督机制等方面进行整改,推进行政公益诉讼的良性运行和全面推进。