随着社会经济的发展以及工农业生产规模的不断扩大，生态环境受到的影响日益严重，这就使环境容量成为稀缺的自然资源。传统的市场方式在配置环境资源时出现了失效的现象，表现为污染的加重和环境质量的恶化。而排放权有偿分配和排放权交易即是解决环境资源配置的一项科学的环境管理方法。排放权有偿分配和排放权交易基于总量控制，以市场为主要调控手段，可为控制污染、缓解环境压力提供有效的解决途径。排放权有偿分配和排放权交易在发达国家已被采用。而在我国，对于排放权有偿分配和交易尚处于起步阶段，故对其理论和应用的研究具有重要的现实意义。　　 本文在分析国内外污染物排放权分配和交易理论的基础上，改进并完善了水污染物排放权有偿分配和交易体系框架结构以及水污染物排放权交易程序流程，将整个体系框架分解为排放权分配系统、排放权交易系统、排放权交易监督系统和排放权交易调控系统，并对排放权有偿分配的方法、定价模式，交易模式的选择及交易的技术方法进行了探讨和研究。针对同一区域内和不同区域间同种水污染物排放权交易的技术方法进行了介绍，明确了包括减少总量、限额交易、设立排放权有效期、完善中介机构和奖惩结合等方面的监督调控措施。论文还提出应以排污许可证制度为基础、与排污收费制度并存、科学确定环境容量和健全的环境保护法律法规作为我国建立科学的水污染物排放权有偿分配和交易的保障措施。　　 作者基于对水污染物排放权有偿分配和交易体系的研究，对南京浦口高新区水污染物（COD）排放权的初始分配和交易体系进行了实践设计，确定了其初始分配的方法、分配模式、分配比例和分配量，对交易价格以及不同类型交易的情况进行了建议和说明，提出了设立排放权交易中心的针对性管理办法，为排放权有偿分配和交易的实施提供借鉴和参考。