蓖麻miR396-GRF/GIF调控模块的鉴定及RcmiR396a基因编辑的初探

来源 :东北林业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jeanstrouse
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蓖麻(Ricinus communis L.)属大戟科,蓖麻油是四大不可食用油之一,是重要的工业用油。蓖麻在各种恶劣的土壤环境中都能顽强生长,具有耐旱、耐贫瘠、耐盐碱诸多优点。由于蓖麻基因组信息不完善,其分子机理方面的研究鲜有报道。miR396是一类保守的内源非编码miRNAs,生长调节因子GRF和GRF互作因子GIF是较为保守的转录因子家族,在调节植物的生长发育和响应生物及非生物胁迫中发挥着至关重要的作用。蓖麻全基因组测序的完成为从分子层面揭开蓖麻miR396-GRF/GIF调控机制奠定了基础。本研究首次在蓖麻全基因组数据中挖掘miR396-GRF/GIF调控网络,并对其进行了系统地分析,得出以下结论:1、根据蓖麻全基因组测序信息,从蓖麻基因组中鉴定得到4个蓖麻miR396家族成员和11个GRF及2个GIF转录因子家族成员。2、RcmiR396可靶向所有的RcGRF成员,其中RcmiR396a和RcmiR396b的靶基因相同。3、10个蓖麻GRF家族成员在不同的组织中均有表达,RcGRF3、RcGRF6和RcGRF10在种子中表达量较高,可能暗示了它们在籽粒发育中发挥作用。4、针对预测到的蓖麻miR396a,构建CRISPR-Cas9敲除载体,尝试对miR396a进行基因编辑。
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