植物病原细菌是一类非常重要的植物病原菌,目前已经描述的植物病原细菌大约有30多个属、650个种。大多数细菌会引起多种农作物、经济作物以及花卉上的病害,造成严重的经济损失。伯克氏菌属(Burkholderia)是一类重要的植物病原细菌,包括了8种不同植物病原菌,均会引起植物不同的病害症状,包括腐烂、枯萎和严重坏死等。因此,如何利用简便、高效的检测手段将病原菌检测出来显得尤为重要。DNA条形码技术突破了传统分类方法对模式标本与分类经验的过度依赖,在鉴定过程中容易实现自动化和标准化,具有检测过程快速、准确、高通量等优点,有效地满足了口岸检疫对现代检测技术的要求,是传统检测鉴定方法的一个良好补充。鉴于此,我们分别从NCPPB菌种库、农业微生物保存中心及中科院微生物所购得共72株伯克氏菌属的菌株,对伯克氏菌属的6条候选DNA条形码基因进行PCR扩增测序,并从扩增效果,测序成功率,种内、种间遗传距离,Barcoding gap及NJ树几个方面进行比较分析。结果表明rpoD基因最适合进行该属内种及致病变种的区分,gyrB基因可作为该属分类鉴定的有效补充。本文中所涉伯克氏菌属的三个种及致病变种均被列入《中华人民共和国进境植物检疫性有害生物名录》。这些检疫性细菌一旦未能高效检出,使其流入国门、传播蔓延以至于在我国大面积发生,必将给我国的蔬菜、粮食生产、生态环境安全以及货物的自由贸易等构成严重威胁。在进境截获的万代兰植株中,发现叶片上有局部黑褐色病斑,进而叶片失绿、变黄,然后叶落。为确定导致叶片局部黑褐色病斑、黄变的病原,首先采样分离病菌,后通过形态特征、培养特性、生理生化鉴定、致病性测定以及Biolog鉴定等方法,对病原菌进行了分离、鉴定和生物学研究,结果确定该致病菌为B.gladioli。为了进一步确定该病原菌的致病变种,我们利用前文所总结出的适用于鉴定伯克氏菌属的几个条形码基因对供试菌株进行PCR扩增测序并建立NJ树进行分析比较,发现该病原菌与B.gladioli现有的三种致病变种的距离都相对较远,在种内单独聚成一支,认为该病菌可能是一个新的致病变种。