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目的:本文分别从基因和次生代谢物水平对浙江省道地药材延胡索的遗传多样性进行了分析,并讨论延胡索的次生代谢物多样性分析和AFLP多样性分析的关系,为特异、分辨率高的生物学鉴定方法的建立,和延胡索优质资源保护、选育优良品种提供一定的科学依据。
方法:采集浙江景宁、磐安、东阳、仙居、永康和缙云种植区共12份延胡索块茎,一:用AFLP分子标记技术分析其基因水平遗传多样性；二:环己烷和甲醇先后提取延胡索块茎中化合物,用HPLC-MS联用技术进行分离检测。用软件NTSySpc2.11e计算Jaccard相似系数、简单匹配系数、相关性系数和PCO分析等。
结果:AFLP的Jaccard相似系数范围为0.2440-0.5444。环己烷、甲醇提取物的简单匹配系数范围分别为0.5198-0.8931和0.5534-0.9182。AFLP的PCO分析和系统聚类结果一致,同一个种植区的样本遗传距离最接近,缙云种植区的两个样本遗传距离最近,磐安1、2和仙居1、2聚为一类,东阳1、2和缙云1、2聚为一类,最后再与景宁1、2聚为一大类；永康1、2单独聚为一类。次生代谢物多样性和基因水平多样性相关性不显著。
结论:基因水平上多样性和次生代谢物水平上多样性反映了延胡索遗传多样性的两个不同方面,应当将DNA标记方法与次生代谢物多样性分析相互补充应用于延胡索多样性评估和种质资源鉴定。