论文部分内容阅读
DNA分子是绝大多数生物的遗传信息的载体,它的三联密码子指导氨基酸按照一定的序列组装成生命活动极为重要的蛋白质分子.在真核生物中,DNA分子缠绕在组蛋白上形成染色质保存在细胞的细胞核中.DNA分子的直径大约为2纳米,但是DNA分子一般都比较长,对人类来说,一般有100厘米左右的长度.这么长的DNA分子是怎么有序的装入微米量级的细胞核中的? 这是DNA分子与组蛋白相互作用的结果.DNA分子带强负电而组蛋白则带正电,库仑相互作用起主要的作用.DNA分子以左手的方式缠绕在组蛋白分子上,形成核小体结构,多个核小体象"念珠"一样串联.然后,核小体链再进一步压缩形成30纳米的螺线管结构.再经过高级结构的堆积形成染色体. 随着单分子操作的实验技术的发展,人们通过光镊、磁镊、微吸管等等,研究DNA分子的力学性质,探索DNA与蛋白质的相互作用,为分子生物学的研究开辟了新的天地. 我们通过布朗动力学数值模拟,对DNA与组蛋白的相互作用进行了研究.在适当的参数条件下,得到了合理的结果,即DNA能够缠绕组蛋白约两圈形成准核小体结构.同时,我们也模拟了DNA与多个组蛋白相互作用的结果,并且得到了核小体链.我们对模拟的条件进行了详细的测试,总结了合理的实验条件.并且,我们提出了组蛋白旋转模型来解释DNA缠绕到组蛋白八聚体上去的方式.