【摘 要】
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多数植物内生菌,尤其是放线菌,在产生物活性次生代谢物方面显示出良好的潜力。苍耳是一种具有实用价值的药用植物,但其内生放线菌多样性及代谢产物方面的研究鲜有报道,因此,开展苍耳内生放线菌资源的研究具有重要的意义。本研究以苍耳作为研究对象,首先利用高通量测序技术了解苍耳不同部位放线菌多样性,然后根据不同部位的多样性丰度,通过纯培养手段,探究可培养放线菌多样性;同时,对潜在新物种进行多相分类鉴定;最后对所
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多数植物内生菌,尤其是放线菌,在产生物活性次生代谢物方面显示出良好的潜力。苍耳是一种具有实用价值的药用植物,但其内生放线菌多样性及代谢产物方面的研究鲜有报道,因此,开展苍耳内生放线菌资源的研究具有重要的意义。本研究以苍耳作为研究对象,首先利用高通量测序技术了解苍耳不同部位放线菌多样性,然后根据不同部位的多样性丰度,通过纯培养手段,探究可培养放线菌多样性;同时,对潜在新物种进行多相分类鉴定;最后对所分离的菌株进行抗菌活性研究,筛选出具有拮抗性的内生放线菌,并对其发酵产物进行初步研究。主要研究结果如下:(1)高通量测序结果表明:苍耳内生菌中,纲水平以下,放线菌物种相对丰度(菌落组成分析)小于0.5%,说明放线菌属非优势微生物;从放线菌的角度而言,Y(嫩茎叶)组和G(果实)组中未鉴定属比例分别为2.7%和6.1%,说明未被鉴定的属和种所占比例较大;Y组中测出有25个放线菌属,无Kytococcus;G组中测出16个放线菌属,无Actinoplanes,Amycolatopsis,Brachybacterium,Cellulomonas,Frigoribacterium,Gaiella,Ilumatobacter,Lapillicoccus,Streptomyces和Solirubrobacter。尽管如此,这些结果仍然暗示着苍耳内生放线菌多样性很丰富。(2)本研究共分离纯化获得放线菌300余株。通过形态学观察和16S r RNA基因序列分析,整合得到58株链霉菌属的成员和1株拟诺卡式菌属的成员。通过培养特征的观察,将58株链霉菌初步归为6个不同的颜色类群;结合培养特征、生理生化特征和基于16S r RNA基因序列的系统发育分析,菌株GGCR-6,CRPJ-33,CRPJ-51和Ben6可能属于潜在的新物种。(3)采用多相分类法对菌株GGCR-6~T的分类地位进行了鉴定。结合形态特征、生理生化特征、化学分类特征、系统发育分析和全基因组序列分析,表明菌株GGCR-6~T代表了链霉菌属的一个新物种,将其命名为Streptomyces aquilus sp.nov.,其典型菌株GGCR-6~T=CICC 11055~T=JCM 33584~T。(4)初步抗菌活性研究表明,58株链霉菌中有24株菌对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、黑曲霉和稻梨孢菌等标靶菌有拮抗作用。鉴于菌株CRPJ-33可能是潜在新种,因而它被选择进行发酵试验。经过发酵,验证,浓缩,化学层析和质谱分析,得到了30种不同的物质,其中,花生四烯酸和金雀异黄素具有直接且有效的抑菌或抗肿瘤活性。据报道,临床上金雀异黄素大多是从纯天然植物中提取获得,但植物生长周期长,其生长受如阳光等外在条件的影响,且需要占用大量的土地资源等。而微生物生长繁殖快,发酵条件简单,不受外在条件的制约,也不需要占用大量土地资源,因此,当前研究中,菌株CRPJ-33发酵代谢产物中金雀异黄素的发现具有重要的实践意义。
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