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柑橘褐斑病(Citrus brown spot)于1903年在澳大利亚的皇帝柑(Emperor Mandarin)上首次发现。随后,美国、以色列、南非、土耳其、西班牙、巴西、阿根廷、希腊和伊朗等国相继报道。近年,柑橘褐斑病在我国陆续发生,危害逐年加重,已引起各地各部门的关注。在2003年云南当地品种塘坊橘上观察到该病害,于2010年我国首次正式报道。自2007年起,广西广东等地贡柑、椪柑上就已见明显褐斑病症状,当地诊断为“急性炭疽病害”,对病原菌的鉴定也没有明确。2011年重庆万州红橘的病害被确认为褐斑病,病原菌鉴定为链格孢菌(Alternaria alternata),为后续的鉴定[作提供了理论依据。为进一步明确我国褐斑病发生情况及其病原遗传多态性,随后我们采集了重庆万州、北碚,广东,广西,浙江,西班牙典型病叶和病果并进行了分离鉴定,得到50株典型链格孢小孢子种菌株,通过致病性测定,形态学和分子鉴定确定为褐斑病病原菌。在鉴定工作中,我们首次在杂柑品种上发现褐斑病菌,并且其发病症状同广东,广西,重庆万州病害症状类似。本研究主要获得以下结果:1.通过田间症状观察、典型样品分离培养和致病性测定,结合形态学和分子生物学方法,首次在国内柑橘杂柑品种上鉴定到柑橘褐斑病菌,并与国内外相关报道对比,认为天草和费尔切尔德杂柑上发生的病害为柑橘褐斑病,根据寄主特异性判断该病原菌应属于橘致病型。广东、广西发病叶片也可分离到链格孢菌株,并完成柯赫氏证病实验,确定为柑橘褐斑病。2.后续实验中我们选取典型菌株ZTGYL-3(重庆万州,红橘)和SP-36(西班牙,克里曼丁)进行了生物学特性研究,测定了影响其菌丝生长的培养因子。结果表明:在PDA等7种培养基上两个菌株均可生长,在PDA、CAA、PCA三种培养基上长势较好;温度对供试菌株菌丝生长有明显影响,差异显著,在5℃-35℃范围内均能生长,最适温度均为28℃,SP-36和ZTGYL-3菌株产孢最适温度分别为20℃、25℃;供试菌株在pH4-11范围内均能生长,在pH5-9范围内长势良好,差异不显著,当pH>11时菌丝不能生长,SP-36和ZTGYL-3菌株产孢最适pH值分别为pH7和pH6。在营养利用方面,在Czapek培养基基础上,用不同碳源和氮源代替,其中供试菌株对可溶性淀粉和蛋白胨利用效果最好,在氯化铵和硫酸铵为氮源的培养基上长势最弱,抑制菌丝和孢子产生。生物学特性研究发现,在不同培养条件下,西班牙菌株生长速率、产孢量均优于重庆菌株,结合世界柑橘褐斑病发病区域、发生时间和致病性测定比较,推测世界发病较早地区致病菌对逆境的适应性也较强。3.选取30株分离致病菌株,根据Peever等人对柑橘相关链格孢小孢子种研究报道,选取EPG,OPA2-1、OPA1-3、OPA10-2等四个基因位点进行遗传多样性研究测定,并对部分菌株的生长速率和菌落形态进行观察记录。测定结果将四个位点结合构建遗传进化树,总体菌群遗传变异与地理来源、寄主品种缺乏相关性,但是,重庆万州桠柑和浙江永嘉瓯柑菌株分支与生长速率有一定相关性,采自广西枝条两菌株在生长速率和遗传关系方面都呈现较大差异。