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目的：国医大师邓铁涛教授临床运用加味补中益气汤治疗重症肌无力(MG)几十年,其治疗效果十分显著。本研究以加味补中益气汤方为例,采用数据挖掘、确定靶标、建立数据库和虚拟筛选的现代计算机方法,研究加味补中益气汤对MG的治疗作用。并在君臣佐使中,找到主要针对乙酰胆碱酯酶(AChE)靶标的草药；对于主要的抗AChE的草药,发现抑制AChE化合物的主要骨架结构；以及发现新的AChE抑制剂；从传统中药复方得到启发,快速找到活性化合物的新方法。方法：1.研究MG发病机制,确定AChE作为研究靶标,从蛋白数据库中获得AChE的晶体蛋白结构。2.通过数据挖掘建立中药复方君臣佐使的化学成分数据库和已知的AChE抑制剂的数据库。3.本研究采用了利平斯基五规则,进行初步的化合物的类药性筛选。4.采用分子二维(2D)、三维(3D)相似度叠合技术和Glide分子对接技术,对中药复方化学成分进行基于AChE抑制剂配体的虚拟筛选。5.骨架分析,得到潜在的抗AChE活性化合物新骨架,从商业数据库中购买相同的骨架的化合物。6.酶的活性实验,以donepezil为阳性对照品,测定24个化合物的IC50值,通过Ellman酶分析实验,找到了5个活性化合物。7用分子动力学模拟的方法进行验证,验证基于分子对接虚拟筛选预测活性化合物的可靠性。结果：通过对MG发病机制的研究,预测AChE该病的主要研究靶标。研究发现加味补中益气汤中的抗AChE活性成分主要是黄酮类的化合物,同时,还发现了一类新的抗AChE的化合物骨架,通过实验验证,找到了5个新的AChE抑制剂X4, X10, X11, X19和X21,IC50分别为6.5±0.23μM,11.4±2.72μM,7.1±1.34μM,10.9±0.48μM,2.3±0.15μm。分子动力学模拟表明,预测的结合自由能△G值与新的AChE抑制剂的生物活性的数据是一致的,呈线性关系。说明通过分子对接筛选活性化合物的技术的可靠性。这项研究表明,新的活性化合物的发现可以从中药材的活性成分骨架中得到启发。结论：本研究的结论如下：(1)加味补中益气汤对重症肌无力具有治疗作用,其中君药和使药发挥了主要作用,臣药和佐药对重症肌无力的治疗可能具有不同的功能。(2)主要的活性成分是黄酮衍生物类AChE抑制剂。(3)本文发现了5个新骨架的AChE抑制剂。(4)本文提供新的研究方法,从传统的中医药经典处方,结合数据挖掘方法研究中药复方活性成分,找到活性化合物。