近年来,“康美药业财务造假”、“獐子岛绝收事件”等一系列具有重大影响力的财务造假丑闻在我国的资本市场上接连爆发,引发社会各界广泛的关注。上市公司有别于一般公司,具有独特的社会责任、公司责任,上市公司由于内部问题轰然倒塌,将会给资本市场带来巨大的经济冲击。内部审计作为公司重要的职能部门,可以帮助公司提早发现经营过程中存在的种种问题,规避财务风险与经营风险等。因此,通过对内审部门进行绩效评价,可以把控内部审计工作的质量,对内部审计工作中存在的问题及时进行查漏补缺,使内部审计工作能够更好的服务于企业的发展,最终达成提升企业价值的目的。本文基于平衡计分卡理论在公司内部审计绩效评价中的适用性,借鉴国内外相关的实践经验和研究理论,综合运用平衡计分卡理论、层次分析法系统分析了内部审计的各项评价指标。首先,本文对平衡计分卡理论进行了分析,阐明了将平衡计分卡用于企业内部审计绩效评价工作的可行性。其次,基于以上的理论研究思路,采用案例分析的研究方法,将Y矿业公司作为研究对象,构建以平衡计分卡为基础的内部审计绩效评价模型,寻找将平衡计分卡合理运用于企业内部审计绩效评价的实现路径。再次,通过实地考察以及问卷调查的取样方法,从Y矿业公司获取相应的数据样本,利用层次分析法和问卷调查法对Y矿业公司的内部审计的绩效进行打分,并对案例企业进行针对性分析。最后,基于上述的理论分析以及案例分析,将优化的评价体系运用于Y矿业公司的内部审计绩效评价工作中,从多个维度出发寻找当前Y矿业公司内部审计工作中存在的不足之处,并提出相应的改进建议和对策,提高上市公司内部审计绩效评价的质量。