COL3A1基因罕见有害变异与散发性胸主动脉夹层发病的相关性分析

来源 :华中科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huangma2009
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研究目的:分析和鉴定COL3A1基因突变与散发性胸主动脉夹层(STAD)发病的相关性。研究方法:本研究采用两阶段病例对照实验,通过高通量测序技术,探索经典致主动脉夹层的基因突变在散发性胸主动脉夹层人群中的分布。第一阶段纳入223例STAD患者和414例健康对照者,进行全外显子组测序,经过位点质量过滤、人群结构分析、亲缘关系分析和祖源关系分析得到高质量的基因变异位点后,筛选和评估29个经典致病基因的变异情况,通过SKAT-O检验鉴定潜在的致病基因;在第二阶段的实验中,我们纳入423例STAD病例和734例对照,针对第一人群所发现的潜在致病基因进行深度靶向测序,按照同样的分析流程,验证第一人群中鉴定的致病基因。研究结果:在第一阶段的病例对照实验中,我们经过严格的质量控制和排除潜在综合征性主动脉夹层的干扰,最后纳入213例STAD和411例对照进行下一步分析。在所选择的29个经典致病基因中,共发现了1952个变异位点,其中有729个位于外显子上,403个非同义突变,174个罕见有害突变。在STAD组中,COL3A1基因突变频率最高,分布于14名(6.6%)携带者;其次为NOTCH1基因(6.1%)、PLOD1基因(3.3%)和FBN2基因(3.3%)。SKAT-O结果表明,仅COL3A1基因突变与STAD发病密切相关(p=7.35 x 10-6)。在第二人群中,我们发现病例组携带COL3A1罕见有害变异的频率明显高于对照人群(4.02%vs3.00%),经SKAT-O检验后p=0.021,差异具有统计学意义。结论:COL3A1基因罕见有害变异与STAD发病密切相关。
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