随着知识经济时代的到来,产业竞争力成为衡量一个国家竞争力的核心,而产业创新正是提升产业竞争力的关键源泉。21世纪产业之间的竞争是以知识为主的竞争模式,知识是产业保持竞争优势所不可缺少的要素和重要资源。知识在人员、企业和机构之间的流动是产业创新过程的关键所在,知识流动的实质是促进创新要素的有效组合,知识流动的规模与效率直接影响着产业创新系统的结构与运行效率。因此,本文在阐述了产业创新与知识流动的理论基础上,通过具体分析中国医药产业知识流动的现状,研究了技术、人才、知识资产的流动与医药产业创新产出的相关性后得出,在中国医药产业的创新中,技术、人才和知识资产的流动越来越频繁,其重要性也日益突出,尤其是技术的流动,大大影响了产业创新的效率。但与此同时,我国医药产业创新的知识流动中,仍存在着创新参与者之间合作不足,技术流动、人才流动、知识资产的流动的制约因素较多,以及外部环境不宽松等诸多问题。因此,在认清了上述障碍后,就应该采取相应的对策,如加强产学研合作创新,发挥企业的核心作用;建立技术转移机制,大力推动技术流动;打破人才流动障碍,构建利益与风险共担的机制解决利益的分配,同时从多方面创造能够促进知识流动的良好的外部环境等,进一步提高中国医药产业创新中的知识流动的效率。