小麦印度腥黑粉菌Tilletia indica Mitra是小麦的一种重要真菌病原物，同时也是一种世界范围内的检疫性有害生物。由于其冬孢子形态特征和近似种非常相似，故仅依靠冬孢子形态特征难以准确鉴定。尽管近年来分子生物学方法开始应用于小麦印度腥黑粉菌的鉴定，但它和近似种黑麦草腥黑粉菌T. walkeri在ITS序列上也仅有一个碱基的差异。而线粒体基因组作为细胞核外的遗传系统，具有完整性、多态性、自主性和小型性等特点，其进化速率是核基因的5～10倍，常用于系统发生学和群体遗传学的研究。因此，对小麦印度腥黑粉菌线粒体基因组全序列的研究，既可以分析其基因组成、基因排列和基因结构特点及其进化特点，也可以通过腥黑粉菌不同种之间的系统分析，进一步阐明小麦印度腥黑粉菌线粒体基因的遗传变异特征，从而为小麦印度腥黑粉菌的检测鉴定提供分子生物学方面的依据。本论文建立了简易快捷的真菌线粒体DNA(mtDNA)的提取方法，测定和分析了小麦印度腥黑粉菌线粒体基因组全序列，并对物种间线粒体基因的进化特点和系统演化进行了分析。主要内容包括：1．小麦印度腥黑粉菌mtDNA的提取。利用两次氯化铯密度梯度超速离心分离得到了小麦印度腥黑粉菌的mtDNA；酶切结果证实是mtDNA。2．小麦印度腥黑粉菌线粒体基因组的分析。(1)全序列及其结构分析：通过构建线粒体DNA文库，测得其基因组全长为65 147 bp(GenBank登录号：DQ993814)，AT含量为71.14％。包含14个蛋白质编码基因，2个rRNA基因，24个tRNA基因。其组成和其它4种担子菌线粒体基因组基本相同，但基因排列差异很大。(2)tRNA的组成及二级结构分析：包含24个tRNA基因，tRNA-Ser与tRNA-Arg各有2个，3个tRNA-Met，其它17种tRNA都只有1个，并绘制了各种tRNA的二级结构。(3)蛋白质编码基因的分析：共编码14种疏水性蛋白质多肽，包括细胞色素b(cytb)，3个atp酶的亚单位(atp6、atp8、atp9)，3个细胞色素C氧化酶的亚单位(cox1、cox2、cox3)，7个NADH还原酶复合体的亚单位(nad1、nad 2、nad 3、nad4、nad4L、nad5、nad6)。它们的起始子都是ATG，终止子有11个为TAA，3个为TAG。其中5个(即nad1、nad4、nad5、cox1、cytb)有内含子，9个为单一的基因(即atp6、atp8、atp9、cox2、cox3、nad2、nad3、nad4L、nad6)。3．小麦印度腥黑粉菌线粒体基因组进化分析。对T．indica的线粒体基因atp6和cytb以及GenBank中各真菌的对应基因进行同源性比较，并构建了atp6和cytb基因序列的系统进化树，为腥黑粉菌的分类鉴定提供了参考。