近年来，我国行政事业单位在提升公共服务质量上进行了一定探索和努力，行政事业单位的依法行政、服务社会水平已有了大幅的提升。但是随着国家简政放权，转变政府职能的推进，全面依法治国、全面从严治党的不断深入，以及全社会的法制意识不断的加强，新形式下全社会对各级行政事业单位的工作开展水平提出了更高要求，而充分实施内部控制是促进行政事业单位依法依规高效履职尽责的必由之路。由于行政事业单位内部控制建设在我国起步较晚，内部控制各项工作如何开展进行还尚在摸索，诸多行政事业单位人员对内部控制还比较陌生，没有成熟的经验可以借鉴，造成在内部控制机制建设中还存在诸多需要解决的难题。税务局作为我国重要的经济执法部门，执法是否精准直接关系到国家各项重大经济决策的落实情况和市场主体的直接经济利益，新时期社会各界同样对税务部门的执法水平提出了更高的要求，此外税收政策有着变化快、数量多的特点，税收执法呈现出风险向基层单位和一线征管干部集中发展的趋势，因此如何保证税务部门的行政执法质量成为迫切问题。
　　本文首先对国内外的管理控制、内部控制等基本理论研究现状进行了阐述，按照时间先后顺序分别对国内外的理论研究发展进行了归类梳理。本文采取了问卷调查、案例研究等研究方法，对税收实践中内部控制基本理论，包括不相容岗位相分离、授权管理、内控报告等七种内部控制方式，以及控制环境、风险评估等五种内部控制要素的应用进行了阐述。本文同时对指导税务内部控制实施的控权论、法治论、风险论等基本理论进行了分析。
　　本文以T市税务局为案例，介绍了T市税务部门的组织架构、职能分工、执法环境、内部控制制度建设等情况，并对税务部门目前在税收管理、纳税申报、税务稽查、纳税服务等各类业务工作中的风险梳理情况进行了阐述。
　　为了了解T市税务局内部控制机制的实际执行情况以及存在的问题和原因，本文在明确研究范围的基础上，科学安排调查问卷活动，通过设计、发放、回收、分析调查问卷，对税务部门不同级别、不同年龄、不同政治面貌等人员的内部控制开展实施情况进行了摸底，发现不同行政级别、年龄层次、不同政治面貌、不同岗位分工的税务人员对内部控制工作开展情况有着一定的差异，对内部控制的认识也存在不同，并对内部控制各要素在具体工作中存在的问题进行了梳理归纳，发现T市税务局存在内控制度缺失、制度与实际相脱节、风险意识淡薄、内控监督检查不到位等问题。同时通过剖析T市各级税务部门近年发生的各类税务执法风险案例，分析T市税务局内部控制建立与实施中存在问题的原因。
　　本文在总结T市税务部门在内部控制中存在问题的基础上，针对发现问题和产生问题原因，针对性的提出了加强税务部门执法内部控制建设的具体措施，包括增强领导层重视程度、建立和完善激励机制、完善内部控制制度、实行内控日常动态管理、建立信息化内控工作模式、提升内控人员素质、优化内部控制组织架构等。在本文最后，得出了内部控制理论得到了一定发展、现有内控机制尚不能应对所有风险、内部控制方式需要与时俱进的三个结论。