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棉花是世界上首要的天然纤维作物,也是重要的油料和蛋白质来源作物。棉花在我国国民经济中占有重要地位。随着科技的进步以及人民生活水平的提高,棉花育种不仅要求提高产量,还要注重改良纤维品质。传统育种方法周期长,效率低,而DNA分子标记技术的发展为棉花育种开辟了快速准确的新途径。利用DNA分子标记构建棉花遗传连锁图谱,定位有利基因,可大大促进棉花纤维产量以及纤维品质的改良。陆地棉和海岛棉是两个异源四倍体棉花栽培种。陆地棉产量高,适应性广,但纤维品质较差。海岛棉纤维品质优良,对黄萎病具有较强的抗性,但纤维产量比较低。构建棉花饱和种间图谱可为棉花种间染色体单片段代换系建立,以及有利基因发掘奠定基础,对棉花基因组研究和分子标记辅助育种具有重要作用。本研究以陆地棉丰产品种中棉所35和海岛棉丰产品种Pima S-7作为亲本,建立了包括188个单株的回交一代群体,利用SSR分子标记构建了棉花异源四倍体海陆种间SSR遗传连锁图谱。研究结果如下：1.SSR引物多态性筛选利用4161对SSR引物对亲本陆地棉中棉所35和海岛棉PimaS-7进行引物多态性筛选,共获得1139对多态性引物,多态性引物占筛选引物的27.4%。2.回交群体标记基因型检测利用1139对多态性引物检测[(中棉所35×Pima S-7)×中棉所35]BC1群体188个单株的标记基因型,共获得1286个SSR标记位点。经卡方检测,1286个位点中有144个偏离孟德尔1：1分离比例(P<0.05),偏分离位点占11.2%。3.海陆群体种间遗传连锁图谱构建对1286个SSR标记位点进行遗传连锁分析,构建的遗传连锁图谱包括1241个SSR标记,26个连锁群,图谱长度3445.4cM,覆盖异源四倍体棉花基因组77.5%左右,标记间的平均距离为2.8cM。