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本研究采用多性状动物模型最佳线性无偏预测(BLUP)和非求导约化最大似然(MTDFREML)以及多性状Gibbs抽样(MTGSAM)对四川省南江县南江黄羊养殖基地的南江黄羊2个品系(快长系、高繁系)的38个性状进行方差组分和遗传力估计，同时进行了固定效应的非遗传因素分析，主要性状的表型趋势、遗传趋势分析，表型相关、遗传相关分析，遗传评定。
研究结果表明，不同年龄阶段的南江黄羊大多数体重和体尺性状受性别、出生年份及其互作、出生年份与出生季节互作效应的影响，达到极显著(P＜0.01)或显著(P＜0.05)水平；受出生季节、性别和出生年份的互作效应的影响未达到显著水平(P＞0.05)；南江黄羊快长系生长发育性状的出生重、体重(2月龄、6月龄)、2月龄(体长、体高、胸围)、6月龄(体长、体高、胸围)的遗传力估计值分别为：0.03(0.02)、0.19(0.29)、0.06、0.15(0.19)、0.17(0.19)、0.18(0.17)、0.14、0.12、0.15，高繁系生长发育性状的出生重、体重(2月龄、6月龄)、2月龄(体长、体高、胸围)、6月龄(体长、体高、胸围)的遗传力估计值分别为：0.05(0.06)、0.23(0.00)、0.11、0.02(0.01)、0.03(0.02)、0.02(0.02)、0.13、0.11、0.01；高繁系繁殖性状的产羔数、总窝重(1-4胎)的遗传力估计值分别为：0.003(0.05)、0.16；高繁系生长发育性状(0-6月龄体重、2-6月龄体尺)和繁殖性状(产羔数、总窝重)的遗传相关分别为：-0.64、-0.06、0.43、0.54、0.44、0.40、0.44、0.52、0.67、0.09、-0.04、0.15、0.18、0.24、0.17、0.23、0.03、0.19。