ARL15基因SNPs与延边朝鲜族和汉族2型糖尿病及糖尿病肾病的相关性研究

来源 :延边大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:abcwangyong
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目的:探讨ADP-核糖基化样因子15(ARL15)基因单核苷酸多态性(SNPs)rs35941、rs26770、rs4311394、rs6450176在延边地区朝、汉族人群中与2型糖尿病(T2DM)及糖尿病肾病(DN)的相关性。方法:采用病例对照设计,随机采集延边地区朝鲜族和汉族751例样本,共分为三组:1.葡萄糖耐量正常对照组(NGT组)朝鲜族131人,汉族137人,共268例;2.T2DM组朝鲜族188人,汉族205人,共393人;3.糖尿病肾病组(DN)朝鲜族35人,汉族55人,共90例。采用单碱基延伸方法对样本进行基因测序及分型;利用酶联免疫吸附法(ELISA)检测全部样本中血清ARL15、脂联素(PA);采集样本的生理指标,如年龄、血压,并根据体重、身高计算体重指数(BMI),用生化检测仪检测各项生化指标。采用连锁不平衡(LD)筛查ARL15基因标签SNP(TagSNP)。结果:1.连锁不平衡分析结果:对ARL15基因4个SNP(rs35941、rs26770、rs4311394、rs6450176)的D’值和r2值绘制了 LD图谱,结果显示rs4311394与rs6450176之间存在强连锁不平衡(D’=0.897,r2=0.780),与rs26770之间属于弱连锁不平衡(D’=0.533,r2=0.117),与rs35941之间也不属于连锁平衡(D’≠0),rs4311394为本次研究4个SNP TagSNP。2.ARL15基因 4 个 SNP rs35941、rs26770、rs4311394、rs6450176 在 NGT 组、T2MD组和DN组中等位基因频率和基因型频率均已达到遗传平衡(P>0.05),具有群体代表性。3.等位基因频率和基因型频率分布比较:4个位点等位基因频率和基因型频率在朝鲜族和汉族之间无差异(P>0.05),因此,全部样本ARL15基因的4个位点等位基因和基因型病例对照关联性分析时不分朝鲜族和汉族。结果显示,DN组ARL15基因rs35941位点的TT+CT基因型频率低于T2DM组(P=0.026),该现象具有隐性遗传特征,但等位基因频率未发现差异(P>0.05)。4.单体型分析结果:ARL15 基因 4 个 SNP rs35941、rs26770、rs4311394、rs6450176存在16种单体型。单体型CTGG在NGT组与T2DM组有显著性差异(P=0.011,OR=0.194,95%CI:0.048-0.787)。NGT组与DN组单倍型随机分布条件下的频数分析统计结果显示,CCGA 在 NGT 组与 DN 组有显著性差异(P=0.011,OR=2.159,95%CI:1.181-3.949)。T2DM组与DN组单倍型随机分布条件下的频数分析统计结果显示,CCGA在T2DM组与DN组有显著性差异(P=0.00,OR=3.720,95%CI:2.005-6.902),CTAG 在 T2DM 组与 DN 组也存在显著性差异(P=0.004,OR=1.803,95%CI:1.209-2.688)。5.阳性的联合基因型与各指标关联分析:将ARL15基因的4个SNPs联合作用进行比较,随机组合能够形成81种基因型组合,本次研究频率小于0.03的基因型组合未纳入统计分析,频率在0.03以上(含0.03)共15组基因型。(1)携带CC-CC-AG-AG联合基因型的频率在 T2DM 组显著小于 NGT 组(P=0.020,OR=0.111,95%CI:0.031-0.931),提示CC-CC-AG-AG联合基因型可能具有保护NGT罹患T2DM作用。但是携带CC-CC-AG-AG联合基因型的频率在DN组中显著大于T2DM组(P=0.005,OR=18.233,95%CI:2.013-165.159),提示CC-CC-AG-AG联合基因型是诱发T2DM合并DN的危险因素,增加了 T2DM罹患DN的风险约18.233倍。(2)携带CT-CT-AG-AG联合基因型的频率在 DN 组中显著小于 NGT 组(P=0.030,OR=0.310,95%CI:0.107-0.897),提示CT-CT-AG-AG联合基因型可能具有保护NGT罹患DN作用。6.在DN组中ARL15与全部指标的相关性分析:ARL15与PA具有相关性,ARL15与 PA 呈正相关(r=0.372,P=0.014)。结论:1.ARL15 基因 SNPs rs35941、rs26770、rs4311394、rs6450176 可能是延边地区朝鲜族、汉族T2DM及DN的易感基因,危险单倍型CCGA可增加人群罹患DN的风险约2.159倍,增加T2DM罹患DN的风险约3.720倍,危险单倍型CTAG可增加T2DM罹患DN的风险约1.803倍。2.携带 ARL15 基因 SNPs(rs35941、rs26770、rs4311394、rs6450176)联合基因型CC-CC-AG-AG可能通过调节TG和PA水平,增加IR,诱发血脂紊乱,促发T2DM罹患DN的风险约18.233倍。3.在DN患者的生化指标相关性分析中得出ARL15与PA表达水平具有正相关性。
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