山杏雄性不育相关基因挖掘及生物信息学分析

来源 :沈阳农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fl908720
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
山杏是我国北方干旱、半干旱地区优良的生态经济型树种,但山杏产业发展中仍存在很多问题,如产量低而不稳、开花早易遭受晚霜冻危害,经济性状衰退以及遗传品质低劣等,其中雄蕊是否正常发育是影响山杏产量的重要因素。基于细胞学观察、转录组测序以及TA克隆等技术手段,本文以山杏无性系为试材,研究了山杏雄性不育发生的关键时期及原因,同时对山杏雄性不育相关基因进行筛选,旨在进一步增加对山杏雄性不育作用机制的理解和认识,同时为利用基因工程技术创制丰产稳产品种提供理论基础。主要研究结果如下:(1)通过形态特征和显微结构观察发现,与可育花相比,在小孢子期,山杏雄性不育花内花粉囊壁未出现退化的迹象,到花粉成熟期,绒毡层和中层细胞降解不充分,花药中止发育,开花后表现为干瘪、萎焉,花粉囊不能正常开裂,因此,确定小孢子期为花药败育关键时期,花粉成熟期为败育后时期。相关生理指标分析结果表明,在花药败育关键时期,山杏雄性不育花内可溶性糖、淀粉以及可溶性蛋白均显著低于可育花,败育后时期雄性不育花内可溶性糖和可溶性蛋白含量显著低于可育花,淀粉含量则显著高于可育花。(2)通过对小孢子期山杏雄性不育花和可育花的转录组数据进行比较分析,共获得4108个差异表达基因,其中在雄性不育花中上调表达的有1899个,下调表达的有2209个。结合BLAST对比分析、功能注释、GO功能富集分析以及KEGG通路富集分析,共挖掘出AsMS1(Cluster-10585.0)、AsMS2(Cluster-6671.20011)、AsSUS1(Cluster-6671.6372)、AsPTRE1(Cluster-6671.3208)、AsAMY1(Cluster-2681.0)5个山杏雄性不育相关基因。实时荧光定量PCR验证结果表明转录组测序结果的准确性较高,可用于分析山杏雄性不育相关基因的动态变化。(3)选择AsMS1、AsMS2、AsSUS1、AsPTRE1和AsAMY1共5个山杏雄性不育相关基因进行TA克隆和生物信息学分析,结果表明,AsMS1与拟南芥中的MS1基因聚为一类,属于PHD-finger(锌指蛋白)家族;AsMS2和AsSUS12单独聚为一类,分别属于FAR(脂肪酰-Co A还原酶)和SUS(蔗糖合成酶)亚家族;AsPTRE1与拟南芥PTRE1相似度最高,聚为一类,属于P131_Prot_N(蛋白酶体调节因子)超家族;As AMY1与拟南芥中的AMY1基因聚为一类,属于AMY(α-淀粉酶)亚家族。
其他文献
随着水稻机械化生产的发展,水田作业机具得以广泛推广,耕种收等机械化水平大幅提高,但现有田间管理作业机具作业时存在泥壤阻力大、功耗高、对秧苗根系损伤较大、地头转弯时压苗严重等问题。为此,本研究提出田间管理机具大跨度田埂行走的作业方法,确定了水田大跨度埂上行走装置设计方案,完成了其控制系统的设计,并进行了试验样机的设计制作与验证试验,主要研究内容及结论如下:(1)对水稻种植农艺及田间管理工作过程进行分
中医特别讲究食补,其中有一种滋补品地位显赫。自明代传人中国,皇亲国戚、达官贵人对它无不钟爱有加,_占装戏里它几乎是必备道具,它就是燕窝。燕窝是雨燕科的几种金丝燕筑巢时分
目的:通过网络药理学方法探索茵陈五苓散防治肝纤维化的作用机制。方法:通过TCMSP数据库检索茵陈五苓散的主要活性成分;通过检索CTD数据库选肝纤维化的疾病靶点;匹配药物-疾
英语课堂教学是一个复杂的系统的过程,它需要老师和学生的双边配合,即“教与学的结合”。如何在英语教学中设置互动的平台,实现师生的互动并提高教学的质量和效果呢?笔者结合自己
针对焦炉机车供电设备中经常出现故障的磨电道支撑结构和磨电刷子进行了优化。磨电道支撑采用角钢支撑代替了原有的槽钢支撑,且角钢支撑的角钢顶角向上,避免了支撑上由于焦炭
以正辛基硅醇和钛酸四丁酯为原料,通过直接缩合法合成了正辛基硅钛聚合物.采用红外光谱(FTIR)、核磁共振氢谱(1H-NMR)、凝胶渗透色谱(GPC)和化学滴定法分别对产物结构、相对分子质量和羟基含量进行了分析.采用动力黏度仪和热重分析仪(TGA)对其性能进行测试.考察了反应条件、溶剂种类和硅钛物质的量比等因素对产率的影响.结果表明,成功地合成了正辛基硅钛聚合物,其产率可达85%左右;硅钛聚合物不但具有较好的流动性(125 Pa·s,50℃),而且热分解温度(失重5%)由原料的370℃升高到448℃,800
在上世纪人们在酵母细胞壁中发现了一种可以促进免疫力的物质,后来经过分离提取并且经过验证这种提高免疫力的物质就是β-1,3-葡聚糖,从此β-1,3-葡聚糖的各种生物学功能一直被人们发现并验证。近年来β-1,3-葡聚糖的利用被人们不断地优化,本试验利用一种高纯度具有可溶性的小分子的β-1,3-葡聚糖作为肉鸡的饲料添加剂以寻求最佳应用效果。本试验以健康、体重相近、大小均匀的初生AA肉仔鸡做为试验动物,设
兰本达教授在《小学科学教育“探究一研讨”教学法》中提出观点:科学教学中材料的结构,意思是指材料在被使用时能揭示自然现象间的某种关系。这里指针对人体消化系统主题而选择
根据《江西省国民经济和社会发展第十一个五年规划纲要》,结合我省民政工作实际,制定了《江西省民政事业发展“十一五”规划》,现予以印发,请认真组织实施。