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目的:了解北京地区实验动物中绿脓杆菌分离株的耐药情况、基因型分布和菌株间的同源性,对绿脓杆菌感染进行溯源和流行病学分析,为绿脓杆菌耐药机制的研究提供依据和菌种资源。比较脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)两种分型方法的优劣。为绿脓杆菌的研究提供北京地区的分型数据。进而为绿脓杆菌感染控制提供依据,同时保障实验动物质量和相关动物实验的顺利进行。方法:(1)收集2007年~2011年北京地区17家实验动物生产和使用单位的绿脓杆菌分离株,使用法国梅里埃API20E细菌鉴定试纸条生化试验及16SrRNA序列扩增和测序进行绿脓杆菌菌株的鉴定;(2)根据美国临床与实验标准化委员会(CLSI)标准和推荐方法,选择青霉素类哌拉西林(Piperacillin, PIP)、β-内酰胺酶抑制剂复合物哌拉西林/他巴唑坦(Piperacillin-tazobactam, PIP-TAZ)、头孢菌素类头孢他啶(Ceftazidime, CAZ)和头孢噻肟(Cefotaxime, CTX)、氨基糖苷类庆大霉素(Gentamicin, GEN)、喹诺酮类环丙沙星(Ciprofloxacin, CIP)、碳青霉素烯类亚胺培南(Imipenem, IMP)、多肽类多粘菌素E(Colistin, Coli)7类8种抗生素,采用琼脂稀释法收集的134株绿脓杆菌分离株进行药敏试验;通过IMP-EDTA协同实验和外膜蛋白OprD编码基因的扩增测序,对耐亚胺培南菌株进行耐药机制分析;(3)采用美国疾病预防控制中心推荐的脉冲场电泳方法(PFGE),经Spe I限制性内切酶酶切后的PFGE指纹图谱用Bionumerics软件进行处理和聚类分析;(4)采用串联重复可变序列分析(MLVA)方法对134株绿脓杆菌进行基因分型,经13个VNTR位点的扩增,利用Bioculator计算出各菌株的每个位点的重复序列数目,用Bionumerics软件对重复序列的多态性特征数据进行处理和聚类分析,并与PFGE分型结果相比较;结果:(1)经过API20E生化鉴定结果软件分析,从2988只实验动物和55份饮水样品中分离的135株疑似绿脓杆菌分离株,除PA73被鉴定为木糖氧化无色杆菌外,其余所有受试菌株的生化结果共产生了21种生化谱,第一鉴定结果均为绿脓杆菌,CMCC10110的API20E生化谱为220200463。其中PA001、PA002、PA060和PA075的鉴定ID%分别为25.2%、25.2%、57.7%和36.9%,其他菌株ID%在98.9~99.9之间,T指数在0.5~1之间。鉴定确认了134株为绿脓杆菌。(2)134株实验动物绿脓杆菌分离株经琼脂稀释法药敏试验,结果存在对CTX,IMP,Coli,GEN,CIP五种抗生素不同程度的耐药,其中对CTX的耐药率为11.9%;对IMP的耐药率为1.5%;对Coli的耐药率为2.2%;对GEN的耐药率为41%;对CIP的耐药率为1.5%;对PIP、PIP-TAZ和CAZ均敏感。存在CTX-Coli-GEN-CIP(n=1)和CTX-Coli-CIP(n=1)多重耐药株和CTX-GEN(n=11)双重耐药。所有耐药菌株均分离自北京市丰台区。对2株亚胺培南耐药株的耐药机制分析表明外膜蛋白OprD编码基因的变异是导致对亚胺培南耐药的主要原因。(3)134株绿脓杆菌分离株经Spe I限制性内切酶酶切后的PFGE指纹图谱用Bionumerics软件进行处理和聚类分析,所有菌株被切出15~20条DNA片段,大小在20Kb~1200Kb之间。共被分为了22个基因簇(A~V),108个基因型,分辨力指数D=0.955。优势簇为J、M、N和U,分别占39/134(29.1%)、15/134(11.2%)、22/134(16.4%)和13/134(9.7%)。各分离地之间的绿脓杆菌大部分为散发感染,个别不同来源菌株具有较高的基因相似度。(4)MLVA所有菌株共被分为32个基因簇,51个基因型,分辨力指数D=0.763,低于PFGE方法。其中12簇的菌数最多,占到了56.7%,其次是21簇,占14.2%。基因分型结果与MLVA数据库比对,各有1株菌与利比亚的和西班牙的分离株有较高同源性。(5)实验动物中绿脓杆菌感染呈现散在分布,来源和时间不同,基因型也随之不同。PFGE与MLVA两方法对IMP、Coli、CIP和GEN耐药株的分型能力相同,PFGE对CTX耐药菌株的分型能力略优于MLVA。结论:北京地区实验动物绿脓杆菌存在亚胺培南、头孢噻肟、庆大霉素、环丙沙星和多粘菌素E的耐药菌株,对庆大霉素和头孢噻肟的耐药率较高。亚胺培南耐药株的耐药机制是由于外膜蛋白OprD编码基因的变异所引起。药敏结果表明大部分菌株对抗生素仍然较敏感,是研究绿脓杆菌耐药机制的良好资源。PFGE与MLVA方法对受试菌株均能有效分型,显示北京地区实验动物中绿脓杆菌的基因型比较丰富,感染源较多,且不同分离地存在基因高相似度的分离株。同一分离地的PA分离株随时间不同表现出不同的基因型,表明存在不同的感染源或变异。实验动物中绿脓杆菌的产生耐药的原因主要为自身变异。两种分型方法对耐药菌株的分型效果基本相同。PFGE的分型能力优于MLVA,而MLVA方法操作简便快速,在检测基因间的相关度方面优于PFGE。