目.的：通过比较同型半胱氨酸代谢酶蛋氨酸合成酶还原酶基因MTRR A66G位点及半胱氨酸蛋白酶抑制剂C (Cystatin C)基因CST3 G73A位点的基因型和等位基因频率在缺血性脑血管病例组和对照组中的分布及血浆同型半胱氨酸(Hcy)水平在各组间的差异,研究MTRR基因及CST3基因与缺血性脑血管病的关系,进一步探索缺血性脑血管病(ICVD)的易感基因,为其防治提供理论依据。方法：(1)采用病例一对照研究,随机选取2008年10月～2009年5月在郑州大学第一附属医院神经内科住院的ICVD患者187例作为病例组,均符合中华医学会第四届全国脑血管病学术会议修定的缺血性脑血管病诊断标准。对照组为性别、年龄与病例组相匹配的同期健康体检的随机个体及同期住院的非ICVD病例共122例,两组均为河南汉族人,各研究对象之间无血缘关系。所有研究对象均除外严重肝肾疾病、癫痫、恶性肿瘤及免疫系统疾病者。(2)所有的研究对象在获得知情同意后抽取清晨空腹外周静脉血5ml,EDTA抗凝提取基因组DNA。采用聚合酶链反应—限制性片段长度多态性(PCR—RFLP)分析技术进行目的基因片段的扩增及酶切PCR产物,琼脂糖凝胶电泳,紫外线凝胶成像仪内摄像并判断基因型；用高效液相色谱荧光法检测血浆Hcy水平。(3)用SPSS16.0统计软件进行统计分析,定量资料比较用独立样本t检验和单因素方差分析,组间基因型及等位基因频率分布分析采用χ2检验,用比数比(Odds Ratio,OR)及95%可信区间(CI)估计基因突变对疾病发生的相对风险率,按Hardy—Weinberg遗传平衡定律检验样本的群体代表性,P<0.05为有统计学意义。结果：(1) MTRR基因A66G位点及CST3基因G73A位点的基因型分布均符合Hardy—Weinberg平衡,说明本研究对象具有群体代表性。(2) MTRR A66G三种基因型在病例组和对照组中的分布总体比较差异有统计学意义(P=0.030)；其中GG型在病例组的分布频率35.3%显著高于对照组的23.0%(P=0.021),与缺血性脑血管病呈正相关(OR：1.831,95%CI：1.091～3.073)；G等位基因在病例组的分布频率62.0%显著高于对照组的52.0%(P=0.014),G等位基因的优势比OR为1.505(95% CI：1.086～2.087)。(3)CST3 G73A基因GG型、GA型和AA型在病例组中的分布分别为55.1%、34.2%、10.7%,在对照组中的分布分别为64.8%、27.0%、8.2%,三种基因型在两组间的分布差异无统计学意义(P>0.05),A等位基因在病例组和对照组的分布分别为27.8%、21.7%,在两组间的分布亦无统计学意义(P>0.05)。(4)病例组HHcy患者检出率显著高于对照组(P=0.005)；MTRR基因三种基因型血浆Hcy浓度总体比较差异有统计学意义(P=0.029),其中MTRR GG基因型携带者血浆Hcy浓度显著高于AA基因型携带者(P=0.025)。结论：(1) MTRR基因A66G位点多态性可能与ICVD相关；纯合子GG基因型可能是ICVD的易感基因型,纯合子突变可能通过升高血浆Hcy水平而影响ICVD的易感性。(2)CST3基因G73A位点多态性可能与ICVD发病无关。