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目前毛壳属Chaetomium内物种的界定主要仍基于形态特征，且大部分物种之间系统发育关系不明确。本文选择印度毛壳Chaetomium indicum与其形态相似种作为研究代表，结合形态观察、最高生长温度测定和DNA序列分析对该类群的系统发育关系进行了研究。同时还尝试将双向电泳蛋白质表达谱用于分析部分菌株之间的关系。
本研究综合各项研究结果，确认了C.indicum，C.funicola，C.erectum，C。dolichotrichum和C.reflexum五个种，否认了C.dolichotrichum作为C.funicola的异名。其中，C.indicum，C.funicola和C.erectum三个种的亲缘关系密切，它们与C.dolichotrichum和C.reflexum这两个种的关系相对较远。形态学研究显示，该类群的顶生子囊果毛形态丰富多样；C.indicum，C。funicola和C.erectum的子囊果毛容易变异，特别是C.indicum和C.funicola界限不清晰；子囊果壁结构有交错丝组织和角胞组织两种类型，将C.indicum，C。funicola和C.erectum这3个种与C.dolichotrichum和C.reflexum区分开；并且，C.indicum，C.funicola和C.erectum的子囊果比C.dolichotrichum和C.reflexum大。最高生长温度方面，C.indicum34℃，C.funicola37℃，C.erectum41℃，差异明显；另外2个种C.dolichotrichum和C.reflexum的最高生长温度分别为37℃和36℃。蛋白质表达谱分析结果支持C.indicum和C.funicola为2个独立的种。结果显示，子囊果毛特征在毛壳属的种的划分中不可或缺。形态、分子以及生理特征的结合使用在毛壳属内种的界定中是行之有效的。最高生长温度可作为区别较近缘的种的补充手段。蛋白质表达谱分析也可以为种间亲缘关系提供有利证据。本研究也是首次尝试将蛋白质表达谱分析应用于真菌的系统发育关系研究中。