肠道菌群与冠心病的宏基因组关联分析

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肠道菌群与机体健康密切相关。现有研究表明,肠道菌群与肥胖、糖尿病、自闭症、炎症性肠炎等疾病的发生发展有着密切联系。临床上关于肠道细菌感染引发心内膜炎的病例早有报道。近几年的分子学研究和流行病学调查显示,肠道菌群代谢的某些产物与人的心血管疾病罹患显著相关。这表明肠道菌群与心血管疾病有着密切联系。目前,国内外对于心血管病人群肠道菌群结构和多样性的研究甚少,而搞清楚心血管病人群肠道菌群组成对研究肠道菌群与心血管疾病发生发展关系又至关重要。本研究首次使用宏基因组学方法,利用Illumina平台高通量测序技术,以细菌16S rDNA基因V3~V5区设计引物,对肠道微生物群进行了扩增并测序。我们共分析了50例非住院冠心病患者和29例住院冠心病患者的肠道菌群结构和多样性,并与35例健康个体进行分析比较。在此之后,我们又构建了八个肠道病毒文库,其中七个为冠心病患者组文库一个为健康对照组文库。利用病毒宏基组学方法,以Illumina Miseq高通量测序技术,对冠心病患者肠道病毒组成进行了初探。物种比对结果显示,冠心病人群肠道菌群在门分类水平上主要由拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、梭杆菌门(Fusobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、软壁菌门(Tenericutes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)组成。拟杆菌门和厚壁菌门为绝对优势菌,所占比例均在40%左右,与健康人群菌群分析结果相似。主成份分析显示,冠心病患者与健康人群在肠道菌群结构组成上存在显著差异。与健康人群相比,非住院冠心病患者拟杆菌门(Bacteroidetes)丰度显著降低(p=0.015<0.05),厚壁菌门(Firmicutes)丰度显著升高(P=0.009<0.01)。而住院冠心病患者与健康人群相比差异主要在厚壁菌门(Firmicutes),其丰度显著升高(P=0.016<0.05)。我们同时还发现,非住院冠心病患者肠道菌群中致病菌多于健康人群,如心内膜炎、口腔疾病相关的Veillonella、Veillonella dispar致病菌,与牙齿疾病相关的致病菌Scardovia、Mogibacterium以及包含大量致病菌的Burkholderia属菌;而维持肠道正常功能方面的有益菌少于健康人群,如拟杆菌门下的Parabacteroides属菌,Bacteroides uniformis,Bacteroides caccae菌等。多样性分析结果显示,非住院冠心病患者与健康人群在肠道菌群多样性方面无显著差异,但是住院冠心病患者肠道菌群多样性却显著高于健康人群。病毒文库分析结果显示,冠心病患者肠道病毒主要由帚状病毒科(Virgaviridae)、微小噬菌体科(Microviridae)、藻类去氧核糖核酸病毒科(Phycodnaviridae)、巨病毒科(Mimiviridae)、乙型线形病毒科(Betaflexiviridae)、长尾噬菌体科(Siphoviridae)、修道院病毒科(Closteroviridae)组成。其中帚状病毒科(Virgaviridae)、微小噬菌体科(Microviridae)为优势病毒科,所占比例分别高达51.71%和39.51%。冠心病组与健康对照组在肠道病毒分布上有很强的饮食相关性,如摄入蔬菜较多而动物性蛋白较少的冠心病组表现出植物性病毒滴度显著高于健康对照组,而禽类来源的环状病毒科(Circoviridae)滴度低于健康对照组。同时冠心病组内肠道致病性病毒如短尾噬菌体科(Podoviridae)、微小核糖核酸病毒科(Picornaviridae)等滴度也明显低于健康对照组。本研究结果表明,冠心病患者肠道菌群结构与健康人群存在显著差异,而肠道菌群多样性方面则会根据患者治疗环境的改变表现出不一样的变化。同时,冠心病患者肠道有致病菌增多、有益菌降低的趋势。对冠心病患者肠道病毒组成的研究结果表明,冠心病患者与健康人群肠道病毒的差异具有很强的饮食相关性。
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