近些年来,国际上有对我国双碳（碳达峰、碳中和）的环保承诺期许,国家提出了“一带一路”等战略,并且推行了“公转铁”和“公转水”等产业政策,多式联运物流行业秉承绿色经济发展理念,在国际社会凸显了多式联运的发展重要性,在国内市场环境受到了诸多青睐。尤其在2020年新冠疫情的冲击下,两年多来外部环境发生了深刻的改变,经济全球化遭遇逆流,许多国家的单边贸易保护主义和内顾倾向凸显。因此,对多式联运效率进行研究有一定迫切性。企业的多式联运物流业务经营策略该如何调整,才能在多式联运物流行业保持竞争优势,是本文所要研究的主要内容。本文在总结国内外现有多式联运效率研究的基础上,结合S公司实际投入产出的特点,以2016～2020年五年20个季度相关固定资产、管理费用、营业成本等数据作为投入指标,构建多式联运物流运输投入产出效率评价体系,通过DEA方法对S公司多式联运效率进行评价分析。然后将S公司投入产出效率进行了分析,根据测算结果得出以下影响多式联运效率的相关因素:经营范围专业化程度,产业链延伸度会影响效率水平;业务拓展、规模扩大等短期内影响资本运营;企业管理费用和研发费用处于一个较低水平;企业的营业成本比较高影响技术效率;物流体系仍需完善;企业风险意识需增强。根据微观和宏观两个层面结合研究分析结果,为多式联运效率的提升提出可行性的建议和对策。从S公司多式联运效率内生动力来说,需要做到:多式联运战略形成共识,并加强多式联运物流体系建设（开拓国内外多式联运市场份额,建设并完善多式联运物流体系）;公司各生产要素配置合理化（物流体系中基础设施建设及配套设施的运营成本使用高效化,合理调配多式联运的运送时间和进出港间隙时间,组织力量进行人力资源管理招聘、培训和薪酬管理）;将信息化、智能化融入多式联运物流体系,整合资源和集成服务;加强科技研发,助推企业产业升级;充分发挥企业规模效应和协同效应,提升企业整体效能;建立完善风险管控体系,确保经营与信用可控。从外部环境来说,完善多式联运法律体系和标准体系,升级相关政策、市场机制;完善运输通道和物流枢纽建设;加大多式联运补贴或税收减免;培养专业的多式联运经营人;加强多式联运运输价格监管和协调。多式联运符合社会经济转型的迫切形式要求,是绿色经济的一种物流发展模式,是行业未来发展趋势,也是企业未来重要利润增长点,更是未来物流企业的战略和运营重点。综上所述,企业提高多式联运效率,有利于提高企业的综合竞争力,在未来的多式联运物流产业竞争中占有一席之地。