本研究利用RAPD标记辅助选择，结合传统选种方法，对番茄品种宝大903和早丰(2份材料)及四川农业大学配制的28份杂交组合材料进行优选，评估参试番茄材料的遗传多样性、青枯病抗性和彼此间的亲缘关系。主要研究结果如下： 综合经济性状和对青枯病的抗性，较优的组合是3号，93号和94号。 DNA提取方面，用E法(0.8g材料+2ml提取液+0.2gPVP)提取的DNA质量比较高，OD260/OD280的比值在1.8-2.0之间，完全符合RAPD的要求。本实验建立的番茄RAPD反应体系和扩增程序比较合理。 对SBS公司的40个RAPD随机引物中筛选到条带较多的多态性引物有3个，用这3个引物对30个番茄材料DNA进行扩增，3个引物共扩增出18条带，其中多态性位点14个，占总位点的78％，但是发病率较低的杂交组合并没有显示出特殊的条带。 30个杂交番茄组合的植物学性状观测值十分相似，很难按照林奈分类系统对它们进行分类研究。而欧氏距离分析植物学形态特征具有明显差异，按照形态学聚类，将30份实验材料分成了四类。第Ⅰ类为37号和23号，即30-1×121和27×123；第Ⅱ类为21号和27号，即美3-4-1-1×123和美3-6-2-×123；第Ⅲ类为8号和16号，即33-1×139和75-1-1×123；其余为第四类。灰色关联度理论分析发现，供试材料的经济性状关联度排序为94＞47＞11＞3=194＞23=24=93＞78＞82=15＞4＞26=31＞12＞13=1＞9=49＞37＞16＞8=10号＞早丰=21号＞宝大903＞27=19＞18＞70号。其中对照宝大903的加权关联度为0.49，排第17位；早丰的加权关联系数为0.50，早丰排16位，所配制的杂交组合除18、19、27、70号外，加权关联度值均高于早丰。在综合性状优良杂交组合和抗青枯病杂交组合的选择中，选出了较好的3号、94号、93号杂交组合，目前正用于区域比较试验。 试验结果还显示，即便有着十分相近亲缘关系的杂交组合中，同一环境对番茄植物学表现的影响差别也十分明显，在植株高度、开展度、果实大小、果实心室数量、可溶性固形物含量、有机酸含量、维生素C含量上都有明显的差异。遗传决定了生物的抗性基础，但是环境对植物的抗性影响也很大。在番茄的杂交育种中，在重发病区可能蕴含着抗病性强的材料。