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[目的]1.了解住院患者耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌(Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae,CRE)肠道定植情况以及由定植继发为感染的情况,分析定植菌与感染菌对抗菌药物的耐药情况;探讨CRE肠道定植以及由肠道定植继发为感染的危险因素;2.分析肠道定植CRE与继发感染CRE之间MLST分型、耐药基因、毒力基因等分子特征的一致性,为CRE感控提供指导。[方法]1.收集昆明医科大学第一附属医院2021年1月-12月非重复肠道定植CRE菌株,监测其感染情况并收集感染菌株。使用基质辅助激光解吸电离飞行时间(MALDI-TOF)质谱仪对菌株进行菌种鉴定,采用VITEK2 Compact全自动细菌药敏鉴定系统、K-B纸片法和E-test法进行药敏试验;2.通过医院His系统收集CRE肠道定植患者以及定植继发感染患者的临床资料,应用SPSS26.0软件采用logistic回归分析探讨CRE肠道定植以及由定植继发为感染的危险因素;3.PCR扩增定植菌和感染菌耐药基因:碳青霉烯酶基因(blaKPC、blaOXA48、blaNDM、blaIMP、blaVIM),膜孔蛋白基因(ompk35、ompk36),喹诺酮类耐药基因(qnrA、qnrB),氨基糖苷类耐药基因(acc(6’)-1b、rmtB),β-内酰胺类耐药基因(blaCTX-M-1、blaCTX-M-14、blaCTX-M-3、blaSHV、blaTEM、blaDHA);毒力基因:黏液相关毒力因子(rmpA),三价铁离子摄取(kfu),Ⅰ型菌毛基因(fimH),Ⅲ型菌毛基因(mrkD),氮利用(sils),脂多糖(wabG、uge),沙门菌素(iroB、iroN),气杆菌素(iutA、iucA),尿素囊(allS),肠杆菌素(entB),MLST分析定植菌与感染菌分子流行病学特征,并送测序。探讨定植菌与感染菌之间的异同点。[结果]1.对昆明医科大学第一附属医院2021年1-12月住院患者CRE肠道定植情况进行筛查。共3116例患者进行了筛查,筛出CRE直肠拭子阳性患者共75例,筛查阳性率为2.41%。其中65例患者检出肺炎克雷伯菌(占86.7%)、8例患者检出大肠埃希菌(占10.7%)、2例患者检出阴沟肠杆菌(占2.6%)。35例患者同时在其他标本类型中检出CRE。2.肺炎克雷伯菌的定植菌和感染菌对多黏菌素和替加环素的敏感率为100%,对阿米卡星的敏感率分别为23.75%和22.22%,对庆大霉素的敏感率为16.25%和17.46%,对复方新诺明的敏感率为31.25%和39.68%;对头孢菌素、β-内酰胺类、β-内酰胺类酶抑制剂、喹诺酮类、碳青霉烯类抗菌药物几乎100%耐药;定植菌与感染菌对抗菌药物的敏感性没有统计学差异,p>0.05。3.CRE肠道定植和定植继发感染的危险因素分析结果显示:单因素分析表明CRE肠道定植与酶抑制剂复合制剂、替加环素、万古霉素、利奈唑胺、精神类药物的使用,侵入性呼吸机治疗、胃管留置、导尿管留置、低蛋白血症、泌尿系统疾病等有关,差异具有统计学意义(p<0.05);多因素分析表明精神类药物使用和胃管留置是CRE肠道定植的独立危险因素,差异均有统计学意义(p<0.001)。单因素分析表明CRE由肠道定植继发为感染与褥疮,酶抑制剂复合制剂、碳青霉烯类抗菌药物、替加环素、利奈唑胺等抗菌药物的使用,中心静脉导管等有关,差异均有统计学意义(p<0.05);多因素分析显示替加环素的使用是定植继发为感染的独立危险因素,差异有统计学意义(p<0.001)。4.MLST分型结果显示,ST11型是肠道定植菌和配对感染菌最常见的克隆型别占 64.7%(22/34),其次是ST231 占 29.4%(10/34),ST690 占 2.9%(1/34),ST592 占 2.9%(1/34);耐药基因检出情况:定植组:bla-KPC(70.6%)、bla-OXA48(29.4%)、acc(6’)-1b(23.5%)、rmtB(58.8%)、qnrA(29.4%)、ompK35(97.1%)、ompK36(91.7%)、blaCTX-M-1(29.4%)、blaCTX-M-14(70.6%)、blaSHV(97.1%)、blaTEM(85.3%)、blaCTX-M-3(50%);感染组:bla-KPC(80.4%)、bla-OXA48(19.6%)、acc(6’)-1b(23.5%)、rmtB(62.3%)、qnrA(25.5%)、ompK35(98%)、ompK36(90.2%)、blaCTX-M-1(19.6%)、blaCTX-M-14(80.4%)、blaSHV(100%)、blaTEM(90.2%)、blaCTX-M-3(49%);检出率p>0.05;毒力基因检出情况:定植组:mrkD(100%)、uge(97.1%)、fimH(97.1%)、wabG(97.1%)、entB(91.7%)、iutA(38.2%)、sils(35.3%)、iucA(26.5%)、rmpA(20.6%)、iroB(20.6%)、kfu(20.6%)、alls(0%);感染组:mrkD(98%)、uge(98%)、fimH(90.2%)、wabG(94.1%)、entB(88.2%)、iutA(41.2%)、sils(31.4%)、iucA(35.2%)、rmpA(27.5%)、iroB(23.5%)、kfu(23.5%)、alls(5.9%),检出率p>0.05。[结论]1.CRE肠道定植率为2.41%,定植CRE与继发感染CRE对抗菌药物的耐药性差异没有统计学意义,p>0.05;留置导管和抗精神类药物使用是肠道定植的独立危险因素;替加环素暴露是肠道定植继发为感染的独立危险因素。2.肠道定植CRE菌株与感染CRE菌株MLST分型一致以ST11型为主,二者携带的耐药基因和毒力基因高度相关。