水利是农业的命脉，小型农村水利工程是农业和农村经济发展的基础设施。搞好小型农村水利工程管理，对促进粮食稳产高产、全面建设小康社会、构建社会主义和谐社会和建设社会主义新农村等都具有重要的地位和作用。近年来，我国农业灌溉出现了供水危机日益显现及灌溉水的利用率很低等新问题。对此，我国基层政府探索了多种方式对小型农村水利工程管理体制进行了改革，主要包括农民用水户协会、承包、拍卖等方式，这些改革起到了促进农民增产增收及农业可持续发展等作用。本文从参与式管理的理论和方法出发，运用规范分析与实证分析的方法，对我国小型农村水利工程的管理体制改革问题进行了分析。本文认为，用水户协会是参与式灌溉管理的主要表现形式，经实践证明也是在全国最值得推广的一种改制方式。然而在我国小型农村水利工程管理体制改革的过程中，仍然存在一些问题，这些问题涉及到有些地方政府基于自身利益考虑不愿意放权、国家没有从政策层面加大对小型农村水利工程登记注册的扶持力度等方面的内容，这些问题若不解决好将会成为农村水利工程管理体制改革的障碍。本文通过比较借鉴发达国家政府参与式灌溉管理的改革措施，结合我国现行的制度环境，运用自主组织与治理理论和参与式管理理论，提出了从加强对灌区管理体制改革的支持力度、对相关人员加强技术等方面的培训、规范参与式灌溉管理改革等方面着手，采取有效措施减少小型农村水利工程管理体制改革中出现的问题。