9个miniSTR基因座在烧骨中的检测及其在西藏藏族人群中的遗传多态性

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目的在300℃焚烧后的成人股骨中,对9个miniSTR(D20S1082、D6S474、D12ATA63、D9S1122、D2S1776、D1S1627、D3S4529、D2S441、Amelogenin)基因座进行检测与分型,探讨该9个miniSTR基因位点在高度降解的烧骨捡材中是否具有较大的优势,并调查其在西藏藏族人群中的遗传多态性,进一步了解其在法医学中的应用价值。方法用改良酚-氯仿法提取烧骨DNA,Chelex-100法提取西藏藏族人群96份无关个体血液样本DNA,分别在eppendorf BioPhotometer plus上检测DNA浓度和纯度,在Mastercylcer pro梯度PCR仪上对该9个miniSTR基因座进行单个扩增,运用3130基因分型仪检测并收集电泳结果,通过GeneMarkerV2.2.0软件计算扩增产物片段相对大小以及进行样本基因型分型。最后通过SPSS16.0软件,对miniSTR基因座单个扩增和IdentifilerTMPCR试剂盒扩增这两种方法在各样本中基因位点的检出率,进行χ2检验比较分析。并应用Modified-Powerstates软件标准版计算该9个miniSTR基因座在西藏藏族人群中的遗传多态性参数。结果在300℃焚烧后的成人股骨中,8个样本提取的DNA浓度平均值为25ng/μl,D260/D280值在1.7-1.9之间。9个miniSTR基因座在8个样本中的检出率分别为89﹪,89﹪,100﹪,89﹪,100﹪,78﹪,89﹪,100﹪,绝大部分基因位点能够顺利地被检出并得到较好分型,但存在少数基因位点在个别样本中随机丢失的情况。9个miniSTR(D20S1082、D6S474、D12ATA63、D9S1122、D2S1776、D1S1627、D3S4529、D2S441、Amelogenin)基因座在西藏藏族人群中检出等位基因分别为5,5,6,7,6,4,5,6,2,均符合Hardy-Weinberg平衡,杂合度(Ho)在0.531-0.742之间,多态信息含量(PIC)分布在0.510-0.720之间,个人识别率(DP)分布在0.750-0.903,累计个人识别率(TDP)为0.999998,累计非父排除率(EP)为0.984083。结论在300℃焚烧后的烧骨捡材中,该9个miniSTR基因座可以作为个人识别和亲权鉴定的参考检测基因位点,较普通试剂盒检测具有优势。该9个miniSTR基因座在西藏藏族人群中的多态性较好,个体识别率高,在法医实践中具有一定的应用价值。
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