高校深化改革是党的十八大的关注点之一，党中央、国务院对此非常重视。对高校校长实施任职责任审计是审计工作的一项重要内容。从2000年起，我国高校全面开展校长任职责任审计工作。在当今形势下，对高校校长实施任职责任审计，不仅是对高校校长自身履行经济职责的监督和考察，也是进一步完善对高校校长监管的重要措施。因此，积极探寻高校校长任职责任审计的评价指标具有重要的理论价值和现实意义。本文旨在制定出一套完整的任职责任审计评价指标体系，在对高校校长经济活动真实性、合法性评价的基础上，以经济性、效率性、效果性的完成情况为重点，对高校校长履行任职责任的情况进行科学的判断与评价。在审计评价中，审计人员既要关注高校整体的运行情况，又要关注其可持续发展的能力和状态；既要关注高校的经济效益，又要关注高校对社会和生态环境作出的贡献，从而促进高校与社会经济的和谐发展。高校校长任职责任审计评价指标的研究是一个实用性较强的研究课题，本文采用规范研究的方法，在介绍国内外高校校长任职责任审计评价指标研究文献的基础上，得出对研究我国高校校长任职责任审计评价指标的几点启示；并结合任职责任审计的理论和任职责任审计评价指标的发展现状，提出一种全新的角度———绩效棱柱法来探索和构建出一套高校校长任职责任审计的评价指标体系。高校校长任职责任包括社会责任和经济责任，本文侧重分析高校校长任职社会责任，需要着重强调的是高校校长任职社会责任有与经济责任交叉的部分，因此在研究方法及指标构建方面会有相似之处。只有运用完整科学的审计评价指标体系才能够有效发挥审计的导向和约束作用，引导和督促高校校长全面把握科学发展观的科学内涵和精神实质，使高校更好的运作，进而为经济社会又好又快发展服务。