m~6A阅读器YTHDF1在宫颈癌的促癌作用及机制研究

来源 :重庆医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xixicoco606
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背景:宫颈癌是女性患者中最常见的恶性肿瘤之一。在中国,宫颈癌的发病率和死亡率逐年增加,严重威胁妇女的健康和生命。尽管HPV疫苗在一定程度上降低了宫颈癌的发病率和死亡率,但晚期宫颈癌患者的预后仍然很差。因此,目前的关键是寻找新的有效治疗靶点。N6-甲基腺苷(m~6A)在真核生物是最普遍的RNA转录后修饰,其关键调节因子甲基转移酶(“writers”)、去甲基化酶(“erasers”)和识别蛋白(“readers”)已被证明在多种癌症中发挥重要作用。目的:通过体内外功能试验明确m~6A关键识别蛋白YTHDF1在宫颈癌进展中所发挥的作用。结合多组学分析揭示YTHDF1促进宫颈癌进展的机制,为宫颈癌的治临床疗提供新的潜在策略和靶点。方法:利用在线数据库cBio Portal的TCGA Pan Cancer Atlas数据集分析m~6A关键调节子在宫颈癌中表达情况,筛选出mRNA水平显著上调的YTHDF1。通过GEO(GSE63514和GSE52904)数据集和Oncomine的Biewenga宫颈癌数据进行分析,比较YTHDF1在宫颈癌及正常宫颈组织中的表达差异。使用Kaplan-Meier生存曲线分析YTHDF1的表达量与患者预后不良的关系。采用shRNA构建敲低YTHDF1的Hela和Siha宫颈癌细胞;通过CCK-8检测宫颈癌细胞的生长情况;克隆形成检测宫颈癌细胞克隆形成能力;流式细胞术检测宫颈癌细胞凋亡情况;transwell法检测宫颈癌细胞的迁移和侵袭能力。裸鼠皮下成瘤实验检测YTHDF1对体内成瘤能力的影响。通过GEO数据库下载Hela细胞的Me RIP-seq数据(GSE46705)及YTHDF1在Hela细胞PAR-CLIP和RIP-seq数据(GSE63591),与Hela细胞中敲低YTHDF1后的Ribo-seq(GSE63591)数据进行交集,结合GO分析结果筛选YTHDF1的候选靶点,通过Me RIP-PCR和RIP-PCR实验筛选验证YTHDF1蛋白下游调控的潜在靶点。采用靶基因sh RNA构建敲低靶蛋白的Hela和Siha宫颈癌细胞,通过CCK8、克隆形成、transwell验证靶蛋白在宫颈癌进展中的作用。构建野生型及m~6A结合域突变的YTHDF1,通过RIP-PCR、实时荧光定量PCR、Western blot揭示YTHDF1调控靶蛋白的机制。进一步在Hela细胞过表达YTHDF1及敲低靶基因的实验进行验证YTHDF1对靶基因的调控作用。收集宫颈癌及正常宫颈组织各12例,用免疫组化法分别检测YTHDF1及靶基因的蛋白表达情况,并对YTHDF1与靶基因表达量的相关性进行分析。结果:数据库cBioPortal、GEO等结果表明YTHDF1在宫颈癌中高表达,生存曲线提示YTHDF1与宫颈癌患者不良预后显著相关。细胞水平的实验表明YTHDF1敲低抑制了宫颈癌细胞的生长,迁移和侵袭,并诱导其凋亡。裸鼠皮下成瘤实验显示敲低YTHDF1抑制了裸鼠宫颈癌细胞的成瘤能力。综合数据库RIP-seq,meRIP-seq及YTHDF1敲低后的Ribo-seq数据生信分析,筛选验证RANBP2为YTHDF1调控宫颈癌进展的重要靶基因。进一步敲低RANBP2抑制了宫颈癌细胞的生长,迁移和侵袭。过表达YTHDF1可以促进Hela和Siha细胞的生长,迁移和侵袭,而同时敲低RANBP2则能逆转过表达YTHDF1促进宫颈癌进展的作用。此外,本文还揭示了YTHDF1通过m~6A依赖的方式调节RANBP2翻译促进宫颈癌进展。最后免疫组化分析临床宫颈癌标本YTHDF1和RANBP2表达呈正相关,进一步验证YTHDF1调控RANBP2促进宫颈癌进展的机制。结论:m~6A识别蛋白YTHDF1促进宫颈癌细胞的增殖,迁移和侵袭。YTHDF1以m~6A依赖性方式调节RANBP2的翻译,进而促进宫颈癌的发生发展。
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