与猪瘟病毒NS5B相互作用的宿主蛋白的筛选与鉴定

来源 :西北农林科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:shengwei05
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猪瘟(Classical swine fever,CSF)是一种重要的猪的传染性疾病,给养猪业造成重大经济损失,该病的病原体为猪瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV)。近些年来已经很少见急性典型病例,主要以温和的非典型性病例为主,然而非典型病例的出现使猪瘟的防控形势更加严峻,持续性感染是猪瘟在我国难以根除的主要原因。目前对 CSF的治疗无有效方法,猪瘟还继续威胁着养殖业,因此研究并阐明 CSFV的致病机制是非常必要的。NS5B 蛋白是 RNA 依赖的 RNA 酶,保守序列为 GDD,负责RNA 复制。NS5B 蛋白具有类似于右手的手指,手掌和拇指形状的结构域,展示了聚合酶典型的一般折叠。已经证明了NS3、NS4A、NS4B、NS5A和NS5B蛋白对于基因组复制是必须的。非结构蛋白和非编码区之间的相互作用参与调控 RNA复制和翻译。然而 NS5B 蛋白也很可能通过与宿主蛋白之间的相互作用来影响 CSFV 的复制和翻译,目前NS5B蛋白与宿主蛋白之间相互作用参与病毒复制的机理并不明确。  本研究以CSFV NS5B蛋白为诱饵,并将诱饵蛋白NS5B克隆到pGBKT7载体上,通过对诱饵蛋白自激活和毒性检测后,将转化有pGBKT7-NS5B的Y2H Gold酵母菌株与 PAM cDNA 文库进行杂交试验,最终从不同营养缺陷型培养基上筛选并得到了 90个阳性克隆,对阳性克隆进行PCR筛选鉴定,最终得到了6 0个阳性克隆,对阳性克隆进行测序。通过将测序结果与 NCBI数据库中序列信息进行Blast比对分析后,最终得到并确认 12个与 CSFV NS5B蛋白相互作用的宿主蛋白。从前期筛选的宿主蛋白中选择可能与 CSFV 复制和细胞自噬相关的甘油醛-3-磷酸脱氢酶(Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)作为进一步深入研究的宿主蛋白,酵母回返试验证实了 CSFV NS5B蛋白可以与 GAPDH蛋白相互作用。随后我们利用 GST-Pulldown和激光共聚焦均验证GADPH蛋白与NS5B蛋白存在相互作用。然而 GAPDH参与CSFV复制和细胞自噬的相关机制还有待进一步的深入研究。  综上所述,本试验通过酵母双杂交技术筛选出了 12个与 CSFV NS5B蛋白相互作用的宿主蛋白,并且利用 GST-Pulldown和激光共聚焦验证了 GADPH 蛋白能够与NS5B蛋白相互作用。
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