行政机关负责人出庭应诉,是由公民、法人或其他组织为维护其合法权益而向法院提起行政诉讼,行政机关的负责人必须按照人民法院的要求出庭应诉的一项制度。对于促进诉讼的开展、化解行政争议、锤炼首长法治思维、树立政府法治形象以及优化诉讼环境具有重要的作用。被法律界和实务界认为是破解当前行政诉讼审理难的突破口。然而,作为新实行的制度,其理论基础和运行机制不够完善,如何使其成为一项成熟稳定的诉讼制度,仍然需要对行政机关负责人出庭应诉现状作出清醒的认识并进行客观全面地分析。作为新修订的制度,其从理论以及实践层面看,仍然存在诸多问题。从理论上看,出庭机关负责人界定不明,出庭要求不明确,不出庭责任模糊且责任不明确。在地方上具体实践时,机关负责人出庭率低,实施效果不明显;一把手出庭少,发言者少,作秀者多。出现上述问题的主要原因是:行政首长思想观念落后,认识不到位;行政诉讼法的专业性,无法应对审判;应诉制不完善,可操作性不强;考核机制不完善和问责制缺乏等。作为一项在地方实践已久,而作为法律确定不久的制度。行政机关负责人出庭应诉制度的价值已经毋庸置疑,行政机关负责人出庭应诉是维护法律尊严和司法权威、提高政府依法行政水平、化解行政争议的良方。进一步完善制度的过程中需要按照如下步骤落实:首先提高机关负责人的法律素质;构建涉诉报备和联动机制;对工作要求予以明确,逐步健全相应的工作机制;最后是构建完备的考核机制和问责机制,保障后续发展。总而言之,行政机关负责人出庭应诉制的建设完善牵涉广,工程量大,务必需要得到司法、行政、立法机关以及社会舆论的大力支持。