本文研究工作依托上海市决策咨询委员会重大课题“崇明生态岛项目研究”进行，并在此基础上有所深入和拓展，着眼于解决以科学发展观为指导的，区域发展中的重大项目方案的决策支持问题。中国的城市化进程，正处在加速发展的关键阶段，这个阶段的一个特点就是各式各样的开发区在全国各地的兴起。各地的经济发展，要走以科学发展观为指导的可持续发展道路，最终都要落实到这些开发区的建设项目上来。项目方案的决策，是一个系统问题，决策的原则和程序，要体现科学化和民主化。项目方案的确立，必须兼顾经济效益、社会效益和生态环境保护等因素，必须率先考虑资源、能源、土地和劳动力的约束。因此，运用决策科学和现代计算机工具，设计一个决策支持系统，具有很高的现实意义和应用价值。本文从区域发展和项目建设的关系入手，提出并设计了面向政府决策层的区域发展项目方案决策支持系统。文章的主要内容和成果有：1、根据当前政府决策科学化、民主化的要求，以科学决策理论为基础，研究和设计了方案决策的总体思路和具体程序；2、根据项目经济评价、环境经济学等有关科学理论和方法，研究并确定了项目评价的影响因子，针对影响因子提出具体评价办法，建立了项目评价的指标体系和若干评价模型；3、模拟人机交互的决策过程，提出了以运筹学、决策科学为基础的一系列决策手段和方法，完成了项目方案提出、优化、选择的决策过程设计；4、设计了面向政府决策层的区域发展项目方案决策支持系统的总体结构，并完成了数据库、模型库、方法库等各子系统的的设计；5、以崇明建设生态岛为例，进行了案例研究。作为示例，用AHP方法确定了各评价指标的权重。