鼻咽癌与淋巴管内皮细胞交互作用的转录组研究

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目的:通过对鼻咽癌与淋巴内皮细胞共培养,建立体外鼻咽癌淋巴管内皮细胞微环境。应用表达谱测序技术检测共培养条件下差异表达基因,探讨鼻咽癌细胞与淋巴管内皮细胞之间的交互作用。找出鼻咽癌淋巴转移相关基因,进一步阐明鼻咽癌淋巴结转移相关机制。方法:分别对鼻咽癌细胞5-8F和淋巴管内皮细胞LEC转染标记红色荧光蛋白与绿色荧光蛋白的慢病毒,并对其行流式细胞仪检测荧光转染率。将转染慢病毒的5-8F和LEC细胞进行活细胞工作站观察共培养下形态学变化。选取共培养72小时后细胞进行流式细胞仪分选。表达谱测序技术检测共培养前后5-8F和LEC细胞表达差异基因,对测序结果进行生物信息学分析。从中挑选3个基因对表达谱数据进行Realtime-PCR验证分析。结果:1.活细胞工作站观察共培养条件下LEC细胞包绕5-8F细胞生长,对比5-8F细胞运动能力较强,并且部分5-8F细胞接触LEC细胞后运动能力增强;2.表达谱数据的聚类分析表明共培养前后肿瘤细胞与淋巴管内皮细胞的基因表达显著差异;3.GO功能显著富集的差异基因主要涉及细胞黏附、细胞增殖、转录调控、信号转导等;4.5-8F与LEC细胞差异表达基因功能富集的Pathway分别为9个和8个;5.Realtime-PCR方法验证3个差异表达基因,其差异表达倍数关系与表达谱测序结果总体趋势相一致。结论:1.共培养前后5-8F和LEC细胞基因表达显著差异,两株细胞之间存在相互作用;2.KEGG数据库对差异表达基因进行Pathway功能富集分析,提示淋巴管内皮细胞微环境可能促使鼻咽癌细胞通过MAPK信号通路发生上皮间质转化,淋巴管内皮细胞可能通过肿瘤中重要信号通路促进鼻咽癌细胞增殖、诱导鼻咽癌细胞发生上皮间质转化。
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