随着重庆市城市社区建设的蓬勃发展，城市基层管理体制改革不断深化，其目标是建立科学、规范、高效的“两级政府、三级管理”的城市管理新体制。在社区建设和城市基层管理体制改革的过程中，城市社区的组织结构和运行机制也逐渐趋于完善，但由于长期以来政府主导模式的惯性依然存在，政府对社区的干预也延续至今，造成社区各类组织的权责定位和相互关系尚不明晰，社区组织的内部结构、权责关系和协调方式还有待进一步的优化和完善。 本文以重庆市Y社区为个案，描述了社区内党组织、政府组织、自治组织、企事业单位、非营利组织等五类组织在社区中所承担的权责和彼此之间的互动关系，以及目前社区的工作机制、人力资源获取机制、资金筹措机制、决策机制、评估机制、激励机制、监督机制、参与机制的现状。认为社区的组织结构体现出科层制组织的垂直结构与网络组织的水平结构相融合的特性，其运行机制是自上而下的行政控制与横向互动的协同合作的综合。其中，科层制的行政控制占有主导地位，导致党组织、政府组织与自治组织之间权限不分、职责不明；社区自治的空间被挤压，社区居民参与意识和自治能力不强，社区自治组织功能尚不成熟；社区非营利组织发育不足。 为此，本文结合系统理论、组织理论、治理理论以及国内外社区组织建设的先进经验，寻求重庆市城市社区的组织结构与运行机制创新的思路和方法。本文认为，应以“以人为本”、“多方参与”和“协调发展”为指导原则，以社区各类组织的角色、功能、关系的合理定位为基本思路，构建包括社区发展委员会、社区自治组织、社区工作站和社区非营利组织的新型社区组织结构和相应的社区运行机制。目的就在于通过构建合理的社区组织结构和完善的运行机制，促使社区组织合理定位，发挥其应有的功能和作用，建立起社区组织之间合理的权责关系，实现社区组织间的良性互动，使社区各类组织实现自身的发展并推动整个社区的协调和可持续发展。