盐藻Cbr基因组序列克隆及生物信息学分析与表达研究

来源 :四川大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:a9249228
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
早期光诱导蛋白(early light-induced protein ELIP)基因是20世纪80年代初研究发现的受光正调控的基因。高等植物及光合微生物在强光照射下会出现光氧化现象,从而引起光合效率降低,光合产物减少。产生这种有害作用时,早期光诱导蛋白迅速被诱导表达,并与游离的叶绿素、类胡萝卜素结合形成抑制三聚体,有效地阻止游离氧对光合结构的进一步损害。盐生杜氏藻(Dunaliella salina)是目前世界上最耐盐的真核光合生物,主要生活在一些盐湖盐田以及海洋中。杜氏藻具有独特的极端环境耐受性,主要集中在耐盐、耐强光照两个方面,对其耐盐的分子基础已有较多研究,而强光耐受机制的研究相对较少。本实验在已克隆到的杜氏藻ELIP基因的cDNA序列的基础上,通过分段克隆的方法克隆该基因的基因组DNA序列,发现这条序列具有ELIP基因所具有的三个外显子,外显子的GC含量比内含子高。然后对这个序列进行了生物信息学分析,发现它与巴氏杜氏藻(Dunaliella.bardwail)Cbr基因高度同源,通过模体搜索,色素结合分析该序列属于叶绿素a/b结合蛋白超家族。二级结构预测和跨膜结构预测,证明具有ELIP基因所特有的三次跨膜结构,跨膜结构一和三都相当保守,并在跨膜结构一中有Glul和Ash4,跨膜结构三中有Glu69和Asn72保守的色素结合位点。以同源性为42%的cab为模板同源模建了该序列的三级结构,同时这两个位点在空间结构上很接近,完全可能为色素结合位点。对杜氏藻进行了高盐震扰,低盐震扰,高光胁迫等处理,Northern杂交结果表明该基因在受到胁迫的最初2h迅速积累,后开始降解。用分光光度法测定。川大学硕士论文了叶绿素a,类胡萝卜素在不同环境下的相对变化,表明受到胁迫后叶绿素a与类胡萝卜素的比值下降。以上的结果都与ELIP的结构,表达相同,证实了该序列为Cbr基因。这条基因的确定不仅对于阐述盐藻光合系统发育及抗光胁迫机制具有重要意义,同时也对研究盐藻适应各种极端环境代谢网络的信号传递过程有所帮助。关键词:cbr基因,生物信息,同源模建,Northern杂交,色素
其他文献
本文用LDH释放法测定了应用转移因子前后的银屑病患者外周血NK细胞活性,结果显示转移因子能显著地提高其NK细胞的杀伤活性,揭示了转移因子对银屑病患者细胞免疫功能的调节作用,佐证了其
【正】 《浪子的历程》是一部带尾白的三幕歌剧,斯特拉文斯基作曲,W.H.奥登和切斯特·卡尔曼编台本,1951年首演于维尼斯。
司法部、外交部、商务部、国务院法制办公室联合发布的《关于发展涉外法律服务业的意见》指出,要发展壮大涉外法律服务队伍。发展公职律师、公司律师队伍,政府外事、商务等涉
综述了近10年来我国有关自我监控学习能力的结构、发展、影响因素、与学习成绩的关系和自我监控学习能力培养与训练方面的研究成果,对自我监控学习能力的研究趋势进行了展望
目的总结免疫健全者重症肺炎后活动性巨细胞病毒感染的临床特征和诊治要点。方法报告2例于我院呼吸重症监护病房诊治的基础免疫健全宿主重症肺炎后巨细胞病毒活动性感染病例,
目的了解美国药物滥用监测预警模式,为我国建立药物滥用风险预警模式提供参考。方法通过查阅相关文献及资料,了解美国现行的药物滥用监测机构及其工作内容。结果与结论美国药
采用潮模砂铸造工艺,多触头高压造型机,中频电炉熔炼铁液,通过合理控制铁液化学成分及低合金化,复合孕育和增硫工艺,采用中间底注式分散内浇道浇注方式,使HT300飞轮壳无冒口
舞蹈和音乐,从产生之初便紧密地联系在一起。音乐决定着舞蹈的结构、特征和气质。舞蹈的外化表达可以让音乐的隐喻信息转化为视觉形象,舞蹈与音乐结合在一起形成完整的舞蹈艺
随着新课改的推进,传统的教学模式淡出了历史舞台,取而代之的是很多新的教学方式,而活动化教学就是其中的一种。教师可以为学生设计游戏性、操作性、体验性、实践性活动,帮助
<正>柳州市位于全国生物多样性保护区的"桂西南山地区",众多的湿地类型,为多种珍稀动植物创造了繁衍生息的场所。近年来,柳州市在湿地保护与恢复方面做了大量工作,并取得一定