本文主要通过荧光光谱、紫外可见光谱、同步荧光光谱、三维荧光光谱和分子模拟等方法在近生理条件下研究了胃蛋白酶与三种核苷类似物(胞嘧啶核苷,FNC以及胞苷酸),人血清蛋白与三种核苷类似物(胞嘧啶核苷,FNC以及胞苷酸),牛血清蛋白与两种化合物(w10,w22),FTO与二羟丙茶碱,胃蛋白酶与安替比林及其类似物五个体系的相互作用。通过以下六个部分完成课题的研究。第一部分概述了蛋白质与药物小分子的相互作用,常见研究方法,本文的研究内容以及研究意义。第二部分研究了模拟生理条件下胃蛋白酶与三种核苷类似物(胞嘧啶核苷,FNC以及胞苷酸)的相互作用。结果表明,三种核苷类似物通过结合胃蛋白酶形成复合物引起胃蛋白酶荧光猝灭。计算得到三个不同的温度下的结合常数和热力学参数。静电引力和疏水作用力对化学键的形成起到重要作用。其中,胞嘧啶核苷是最强的淬灭剂,要比其他两种核苷类似物结合胃蛋白酶的亲和更高。FNC中的F原子可能削弱了核苷类似物与胃蛋白酶的结合。第三部分在模拟生理条件下对人血清蛋白与三种核苷类似物(胞嘧啶核苷,FNC以及胞苷酸)的相互作用进行了研究。结果表明,三种核苷类似物能够结合人血清蛋白,使人血清蛋白固有荧光发生静态猝灭。形成的化学键随着温度的升高,稳定性降低。计算得到三个不同的温度下的结合常数和热力学参数。对FNC和胞苷酸,疏水作用力和静电引力对化学键的形成起到重要作用,而对胞嘧啶核苷,疏水作用力主导了化学键的形成。其中,胞苷酸是最强的淬灭剂,要比其他两种核苷类似物结合人血清蛋白的亲和更高。胞苷酸中的磷酸基团可能加强了了核苷类似物与人血清蛋白的结合。第四部分为模拟生理条件下牛血清蛋白与两种化合物(w10,w22)的相互作用研究。结果表明,两种化合物使牛血清蛋白固有荧光猝灭的猝灭机制为静态猝灭;两种化合物与牛血清蛋白之间发生了相互作用,并形成了复合物,因而牛血清蛋白的构象发生了改变,复合物的稳定性随温度的升高而降低;计算得到两个不同的温度下的结合常数和热力学参数;疏水作用力和静电引力在复合物的形成过程中发挥了重要的作用。第五部分研究了FTO与二羟丙茶碱的相互作用。结果表明,二羟丙茶碱使FTO固有荧光猝灭的猝灭机制为静态猝灭;二羟丙茶碱与FTO发生了相互作用,并形成了复合物,因而FTO的构象发生了改变,复合物的稳定性随温度的升高而降低;计算得到三个不同的温度下的结合常数和热力学参数;疏水作用力和静电引力在复合物的形成过程中发挥了重要的作用。第六部分研究了模拟生理条件下胃蛋白酶与安替比林及其类似物的相互作用。结果表明,安替比林以及氨基比林使胃蛋白酶固有荧光猝灭的猝灭机制为静态猝灭,而4-氨基安替比林引起胃蛋白酶的猝灭机制可能为混合猝灭;安替比林以及氨基比林与胃蛋白酶发生了相互作用,并形成了复合物,因而胃蛋白酶的构象发生了改变,复合物的稳定性随温度的升高而降低;计算得到两个不同的温度下的结合常数和热力学参数;疏水作用力和静电引力在复合物的形成过程中发挥了重要的作用。