XIAP蛋白UBA和BIR2结构域的核磁共振研究

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X-染色体相关的凋亡抑制蛋白(XIAP),是IAP家族中最有效的Caspase抑制剂,全长有497个氨基酸,分子量约57 kDa,包括3个BIR结构域、一个RING结构域和一个UBA结构域。BIR结构域是一个大约有70个氨基酸残基并且有一个锌指结构片段,位于XIAP蛋白的N端。BIR1结构域可以激活下游TAK1信号途径;BIR2/BIR3结构域可以有效地结合并抑制caspase-3、caspase-7及caspase-9的活性。碳末端RING结构域可以作为泛素连接酶E3酶,能够介导XIAP自身以及与它相互作用的蛋白分子泛素化,以抑制细胞的凋亡。XIAP的UBA结构域相对BIR结构域和RING结构域被发现的相对晚一些,研究的也少。UBA位于BIR3结构域与RING结构域之间,约有80个氨基酸残基,并能够与Ubiqutin相互作用。Ubiqutin除经典界面残基发生化学位移以外,还有尾端残基。尾端残基是否与UBA结合还不清楚。本论文在第二章通过高分辨核磁共振技术,详细的探究了野生型Ubiquti以及尾端切掉后Ubiqutin与UBA结合状态,测定了结界面上的残基以及结合常数,发现尾端切掉后Ubiqutin与UBA结合力变弱,说明尾端在结合中起重要的作用。  本文为探究XIAP与铜的作用机制,截取XIAP的BIR2结构域作为研究对象,对BIR2野生型及突变体的表达与纯化进行了探索,并获得了15N同位素标记稳定的可溶蛋白,利用高分辨核磁共振得到了野生型及突变体的2D1H-15N HSQC谱图,为下一步利用高分辨核磁共振,探究单独BIR2结构域与铜离子的结合机制打下基础。
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