自财政部2012年12月发布《行政事业单位内部控制规范》以来,我国政府部门内控建设有了政策支持和理论依据,中国政府内控正式起航,内部控制成为行政事业单位的一项重点工作。《行政事业单位内部控制规范》已经实施五年多,各单位已经逐步开展内控建设。从整体上看,我国政府部门内部控制还处于起步摸索阶段,现阶段存在发展不平衡问题,一些事业单位内控建设生搬硬套走过场,执行情况不容乐观。科学事业单位作为提供科技类社会化公共服务产品的组织,是国家创新体系的重要组成部分,承担着促进我国科学事业发展的重要职能。作为承担国家科技项目的重要力量,科学事业单位内部控制体系完善程度,直接影响科技项目执行的好坏。本文介绍了我国事业单位内部控制现状,针对一些事业单位内控建设形式重于实质问题,剖析了事业单位内部控制普遍存在的问题。基于COSO内部控制框架五要素理论,以A科学事业单位作为案例,介绍A单位内控建设亮点,分析其内控建设成效突出的原因,得出推动我国科学事业单位内部控制有效实施的几点建议,希望对其他科学事业单位内控建设有一定的借鉴作用。