国家“十二五”科学和技术发展规划中指出当下我国科技创新能力加速提升，科技资源总量快速增加，科技支撑引领作用日益凸显，自主创新环境不断优化。科学传播事业应与经济、政治、文化、社会的发展是相一致的；在科学传播领域发生的问题与存在的不足同样影响着国家的对外经济交往与文化传播。可见，如何将我国的科技成果进行更好地传播以展示给世人是当下科技发展所需解决的重要问题之一。科普网站作为科技信息传输的平台，承担着巨大的使命。　　而科技传播的大环境已从互联网的“门户网站时代”到“搜索引擎时代”，全面进入“社交网络”时代。而这一时期，传播者、受传者、传播内容、传播介质实现了完全融合，以微博、微信为代表的自媒体得到快速普及和发展，自媒体技术的日新月异和极速发展，不仅使传播内容的碎片化，传播群体的多元化，而且开启了新的科学技术观，成为当代科技知识最重要、最便捷的传播渠道，它在科技传播的长远发展中也将扮演着越来越重要的角色。　　科普网站如何在自媒体环境下发展是本文研究的目的。为了进行客观科学地研究分析，本文在对国内外科普网站评价指标体系研究的基础上，从可评判性的角度出发，建立了一套自媒体环境下我国科普网站发展评价指标体系，分别对各个指标的评价标准做出了详细的阐述。依据一定的筛选标准选取了4家典型科普网站作为研究样本，利用该体系分别对其基本情况、首页内容、互动功能以及与自媒体应用四个方面进行比较分析。　　通过比较分析，发现了在当前自媒体环境下，我国科普网站的发展存在着以下问题：网站重复建设过多，传播主体过度泛化；科普网站内容原创不足，娱乐性与科学性分离；网站互动功能未充分发挥，用户黏性较差；自媒体优势大打折扣，媒介应用单一。　　针对调研发现的突出问题，本文从以下四个方面提出了建议与对策：第一，规范科普网站管理，提升科普主体整体队伍水平；第二，提高网站内容原创率，科学性为第一要素；第三，重视受众需求，升级网站互动功能；第四，整合媒介资源，实现跨界立体式发展。