药品是治病救命的健康性消费品,与人民群众身体健康和生命安全息息相关,保障药品安全是建设健康中国的重要内容。飞行检查在我国已实施多年,2015年《药品医疗器械飞行检查办法》的出台,标志着飞行检查在药品安全监管领域的广泛应用。作为一种突击性监管手段,飞行检查覆盖药品生产经营等多个环节。药品飞行检查有助于威慑违法违规行为,强化药品安全风险防控。药品飞行检查不仅具有突击性、独立性和高效性等特点,更具有其内在制度体系和外在实施的程序规定。为了使药品飞行检查能够依法独立、扎实有序开展,保证各环节顺畅衔接,提高查办效率,在理论探讨的基础上,通过文本分析法对药品飞行检查相关法律法规的文本规定进行解读,并采用实证研究法对药品飞行检查的实施效果进行考察。药品飞行检查存在保密制度有待完善、回避制度规定模糊、权利救济制度缺失、行刑衔接制度不畅、执法人员地位不清等问题,针对药品飞行检查所存在的法律问题,提出具体对策,以实现药品飞行检查的公正性和权威性。